RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 ELF2Q15723 593 aa3.12□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 DUSP6Q16828 381 aa3.12□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.12□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAMK1DQ8IU85 385 aa3.12□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 POC1AQ8NBT0 407 aa3.12□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR14A16Q8NHC5 309 aa3.12□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF347Q96SE7 839 aa3.12□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.11□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP6R2O75170 966 aa3.1□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 AMTP48728 403 aa3.1□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 SEMA3BQ13214 749 aa3.1□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.1□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.1□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPINK14Q6IE38 97 aa3.1□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.1□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZBTB46Q86UZ6 589 aa3.1□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.1□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 EGFL8Q99944 293 aa3.1□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.1□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 C22orf23Q9BZE7 217 aa3.1□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ITGB8P26012 769 aa3.09□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 PMS2P54278 862 aa3.09□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.09□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM72DQ6L9T8 149 aa3.09□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 TLDC1Q6P9B6 456 aa3.09□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM72BQ86X60 149 aa3.09□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.09□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 KDM1BQ8NB78 822 aa3.09□□□□□ -1.91
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CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.09□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.09□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 NMRK2Q9NPI5 230 aa3.09□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa3.09□□□□□ -1.91
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNTN5O94779 1100 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSPA6P17066 643 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 ST3GAL1Q11201 340 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNGA2Q16280 664 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 LPAL2Q16609 132 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 AIFM3Q96NN9 605 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL17FQ96PD4 163 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.08□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 CACNA1FO60840 1977 aa3.07□□□□□ -1.92
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CACNA2D1-211ENST00000486539 TUSC2O75896 110 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 SOX30O94993 753 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNLYP22749 145 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC16A2P36021 539 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUDT6P53370 316 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 EFHC1Q5JVL4 640 aa3.07□□□□□ -1.92
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