RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SPON1Q9HCB6 807 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 UMPSP11172 480 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 NTSP30990 170 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 NEK3P51956 506 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 USP45Q70EL2 814 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TRPV3Q8NET8 790 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ITFG1Q8TB96 612 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 S100ZQ8WXG8 99 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ANKRD7Q92527 254 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CIPCQ9C0C6 399 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 INVSQ9Y283 1065 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 KCNH1O95259 989 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PRG2P13727 222 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 S100A3P33764 101 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CBX5P45973 191 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CYP2A13Q16696 494 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 DSN1Q9H410 356 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SNX6Q9UNH7 406 aa6.81□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SLC25A12O75746 678 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 LYNP07948 512 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 STARP49675 285 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 STYK1Q6J9G0 422 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FIG4Q92562 907 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CRB1P82279 1406 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CYP2B6P20813 491 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 GLRBP48167 497 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ACLYP53396 1101 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FOXO4P98177 505 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SPIDRQ14159 915 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 GPSM1Q86YR5 675 aa6.8□□□□□ -1.32
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USP46-201ENST00000441222 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 METTL6Q8TCB7 284 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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USP46-201ENST00000441222 CGRRF1Q99675 332 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 THAP2Q9H0W7 228 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CSHL1Q14406 222 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ACOT1Q86TX2 421 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 LENG9Q96B70 501 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SERPINB11Q96P15 392 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PHF11Q9UIL8 331 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CCDC182A6NF36 153 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TRIM66O15016 1216 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 CHP2O43745 196 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 XYLBO75191 536 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 GCATO75600 419 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FGFR1P11362 822 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 AXLP30530 894 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 GPR1P46091 355 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SLC34A1Q06495 639 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TRIM32Q13049 653 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 PACS1Q6VY07 963 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 KCNMB4Q86W47 210 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 OPTCQ9UBM4 332 aa6.8□□□□□ -1.32
USP46-201ENST00000441222 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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