RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CSPG4P5Q96PW8 444 aa30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 ZYG11BQ9C0D3 744 aa30.45■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 ADH5P11766 374 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 HOXC13P31276 330 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 HTR7P34969 479 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ALFQ53S48 1182 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 MFSD7Q6UXD7 560 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC50Q8IVM0 306 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA4Q8NEY3 305 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF670Q9BS34 389 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 MARK1Q9P0L2 795 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 COL4A3Q01955 1670 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 DAPK3O43293 454 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 NARSO43776 548 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 HCAR3P49019 387 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 MPP7Q5T2T1 576 aa30.44■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 PENKP01210 267 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 PYGMP11217 842 aa30.43■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 TYRP14679 529 aa30.43■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 GAD2Q05329 585 aa30.43■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 NR1H3Q13133 447 aa30.43■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa30.43■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa30.43■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa30.43■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa30.43■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 COL4A2P08572 1712 aa30.42■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GVM2 712 aa30.42■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 TCAF2A6NFQ2 919 aa30.42■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 CDKN2BP42772 138 aa30.42■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 DPYSQ14117 519 aa30.42■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa30.42■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 SEL1L2Q5TEA6 688 aa30.42■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa30.42■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa30.42■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 RHOQP17081 205 aa30.41■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 CDH4P55283 916 aa30.41■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 LLGL1Q15334 1064 aa30.41■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 AADACL2Q6P093 401 aa30.41■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 VSIG1Q86XK7 387 aa30.41■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 FAF2Q96CS3 445 aa30.41■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 TRPV5Q9NQA5 729 aa30.41■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF4Q9NR80 690 aa30.41■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 SRFP11831 508 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ERCC2P18074 760 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 AMPD1P23109 780 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 CHST9Q7L1S5 443 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 NLRP14Q86W24 1093 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 RNF135Q8IUD6 432 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 CARNMT1Q8N4J0 409 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 MMGT1Q8N4V1 131 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 PCDH19Q8TAB3 1148 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF487B1APH4 448 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 DYNC1I1O14576 645 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN11O75508 207 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 COPS2P61201 443 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 TAZQ16635 292 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 GAB4Q2WGN9 574 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 TFDP3Q5H9I0 405 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 RNF43Q68DV7 783 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 NAT16Q8N8M0 369 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 DNASE1L2Q92874 299 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 RNF157Q96PX1 679 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM248Q9NWD8 314 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF212Q9UDV6 495 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC4EQ9ULY5 219 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 SORCS3Q9UPU3 1222 aa30.4■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 KRT10P13645 584 aa30.39■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 GJA4P35212 333 aa30.39■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa30.39■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 GJD3Q8N144 294 aa30.39■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa30.39■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 NDFIP2Q9NV92 336 aa30.39■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa30.39■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 DUSP12Q9UNI6 340 aa30.39■■■□□ 2.46
ECHS1-201ENST00000368547 MIA3Q5JRA6 1907 aa30.39■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 H0Y626 953 aa30.38■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 FGGP02679 453 aa30.38■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 TJAP1Q5JTD0 557 aa30.38■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 TEX35Q5T0J7 233 aa30.38■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 MFN1Q8IWA4 741 aa30.38■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 WFDC5Q8TCV5 224 aa30.38■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 ETNK2Q9NVF9 386 aa30.38■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa30.37■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 WASH4PA8MWX3 477 aa30.37■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC188H7C350 402 aa30.37■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 DCLK1O15075 740 aa30.37■■■□□ 2.45
ECHS1-201ENST00000368547 CACNG3O60359 315 aa30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms