RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL6Q8TCB7 284 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 AGAP11Q8TF27 550 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 OLFM1Q99784 485 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ATAD3AQ9NVI7 634 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MIPP30301 263 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 IL12RB1P42701 662 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RENBPP51606 427 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CHN2P52757 468 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RRN3Q9NYV6 651 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZMYM5Q9UJ78 669 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPRMP28827 1452 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 HMGCRP04035 888 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CKMP06732 381 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RARRES1P49788 294 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 NEK3P51956 506 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SYTL1Q8IYJ3 562 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK20Q8IZL9 346 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM63Q969Q1 353 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM169Q96HH4 297 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR41Q9HAD4 459 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 LRPAP1P30533 357 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 NRF1Q16656 503 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 C16orf46Q6P387 395 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL17Q6TDP4 642 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 HPGDP15428 266 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CBWD6Q4V339 395 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SCUBE3Q8IX30 993 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PHACTR4Q8IZ21 702 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 UBASH3BQ8TF42 649 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SERAC1Q96JX3 654 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX3O60493 162 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RBL1P28749 1068 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF43Q68DV7 783 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNT2Q6UVM3 1135 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF605Q86T29 641 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 NACC2Q96BF6 587 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ASB2Q96Q27 587 aa24.61■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM86B1E9PN63 330 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PIGNO95427 931 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC12A3P55017 1021 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 DMPKQ09013 629 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS72Q15906 364 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SPANXN2Q5MJ10 180 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL7BQ6UX53 244 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ETNK2Q9NVF9 386 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RAMP2O60895 175 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PAEPP09466 180 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBP50607 506 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF544Q6NX49 715 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL12BO14950 172 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MFN2O95140 757 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC6A3Q01959 620 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TGM3Q08188 693 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 AHSPQ9NZD4 102 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 UXS1Q8NBZ7 420 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 DGCR6LQ9BY27 220 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL1Q9NR64 748 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 AAASQ9NRG9 546 aa24.6■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 BTN3A1O00481 513 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TBX4P57082 545 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ARPINQ7Z6K5 226 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF276Q8N554 614 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CHKBQ9Y259 395 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BN98 237 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC5CO95185 931 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF5Q15542 800 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FGD3Q5JSP0 725 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMC3Q5W041 872 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.59■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF286BP0CG31 522 aa24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms