RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 ASGR1P07306 291 aa20.48■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 MYL2P10916 166 aa20.48■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 FCGRTP55899 365 aa20.48■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 DSC3Q14574 896 aa20.48■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 AGAP11Q8TF27 550 aa20.48■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 RNF34Q969K3 372 aa20.48■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.48■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 DSEQ9UL01 958 aa20.48■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 TPP1O14773 563 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 LRIG2O94898 1065 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 NKX3-2P78367 333 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 OCRLQ01968 901 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 GRIK3Q13003 919 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 TRIM32Q13049 653 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 TEX44Q53QW1 395 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 CES4AQ5XG92 561 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 CERS2Q96G23 380 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 PKMYT1Q99640 499 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 ADAM2Q99965 735 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 GBA3Q9H227 469 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 M0QZQ0 153 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 ITGA2BP08514 1039 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 ERVK-10P10266 1014 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 SREBF2Q12772 1141 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 ZBTB17Q13105 803 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 TUSC3Q13454 348 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 LPIN1Q14693 890 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 WLSQ5T9L3 541 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 SCML4Q8N228 414 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 BFARQ9NZS9 450 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.47■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 GLRA3O75311 464 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 PTPN4P29074 926 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 FLT3LGP49771 235 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 PDE1BQ01064 536 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 RSPH1Q8WYR4 309 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 TMEM209Q96SK2 561 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 CASS4Q9NQ75 786 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 NFKB1P19838 968 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 IRX4P78413 519 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 KCNA10Q16322 511 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 KCTD11Q693B1 232 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 LONP2Q86WA8 852 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 ATP2A3Q93084 1043 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 VAT1Q99536 393 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.46■□□□□ 0.87
CXCL16-201ENST00000293778 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 CCND1P24385 295 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 GP5P40197 560 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 DBN1Q16643 649 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 C16orf46Q6P387 395 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 UROC1Q96N76 676 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 EMCNQ9ULC0 261 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 WFS1O76024 890 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 PAX3P23760 479 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 YY1P25490 414 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 STX3Q13277 289 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 CPNE1Q99829 537 aa20.45■□□□□ 0.86
CXCL16-201ENST00000293778 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms