RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa25.91■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 KBTBD6Q86V97 674 aa25.91■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 VSTM4Q8IW00 320 aa25.91■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 RLN3Q8WXF3 142 aa25.91■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 ZNF653Q96CK0 615 aa25.91■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa25.91■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 E9PAM4 449 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 CLDN11O75508 207 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 ASLP04424 464 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 HLA-EP13747 358 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 NDUFV2P19404 249 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 NUMBP49757 651 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 CDH4P55283 916 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 OXCT1P55809 520 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 HDAC4P56524 1084 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 ST8SIA6P61647 398 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 MAMLD1Q13495 774 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 SLC12A1Q13621 1099 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 PTPRNQ16849 979 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 PLEKHG6Q3KR16 790 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 APCDD1Q8J025 514 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 ZNF366Q8N895 744 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 TTC17Q96AE7 1141 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 TRIM11Q96F44 468 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 SPACA7Q96KW9 195 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 CD248Q9HCU0 757 aa25.9■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 CNTN5O94779 1100 aa25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 ADRA1BP35368 520 aa25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 C5orf22Q49AR2 442 aa25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 DCLK2Q8N568 766 aa25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 CNPY3Q9BT09 278 aa25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 SLC6A17Q9H1V8 727 aa25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 MPP6Q9NZW5 540 aa25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.89■■□□□ 1.74
PDF-201ENST00000288022 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ELF2Q15723 593 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ALFQ53S48 1182 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 C11orf74Q86VG3 221 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ZNF683Q8IZ20 524 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 CCDC185Q8N715 623 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 MRGPRX1Q96LB2 322 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 TRIM5Q9C035 493 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ISCUQ9H1K1 167 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 TMEM245Q9H330 911 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ERVW-1Q9UQF0 538 aa25.88■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 MAP3K13O43283 966 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 MYBL1P10243 752 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 PSMA2P25787 234 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 P2RY2P41231 377 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ECT2LQ008S8 904 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 TMC6Q7Z403 805 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 MUC3BQ9H195 1237 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 OR12D3Q9UGF7 316 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 SCINQ9Y6U3 715 aa25.87■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 A0A087X0T9 212 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 DRGXA6NNA5 263 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 RHOBTB1O94844 696 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 RHOCP08134 193 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 FAM228BP0C875 321 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 OGDHQ02218 1023 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 PLK5Q496M5 336 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 SARM1Q6SZW1 724 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 SLFN11Q7Z7L1 901 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 OR52K2Q8NGK3 314 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 ZYG11BQ9C0D3 744 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 SUN2Q9UH99 717 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 VPS28Q9UK41 221 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 MYO15AQ9UKN7 3530 aa25.86■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 VPS13AQ96RL7 3174 aa25.85■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa25.85■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 RETP07949 1114 aa25.85■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 BCKDHBP21953 392 aa25.85■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 PLK1P53350 603 aa25.85■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 SULT2A1Q06520 285 aa25.85■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 MAP7D1Q3KQU3 841 aa25.85■■□□□ 1.73
PDF-201ENST00000288022 CACUL1Q86Y37 369 aa25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms