RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 EPHB6O15197 1021 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 BST1Q10588 318 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TTLL9Q3SXZ7 439 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZNF470Q6ECI4 717 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TMC7Q7Z402 723 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ASB14A6NK59 587 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NFIXQ14938 502 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PLA2G4CQ9UP65 541 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 DNM1LO00429 736 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NCAM2O15394 837 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ITGAVP06756 1048 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PTGS2P35354 604 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 FLT3P36888 993 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NEK3P51956 506 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NAT14Q8WUY8 206 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 HTR3CQ8WXA8 447 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 POMKQ9H5K3 350 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZNF606Q8WXB4 792 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MBOAT7Q96N66 472 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 UQCRBP14927 111 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PPP4CP60510 307 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZNF284Q2VY69 593 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 LRRC19Q9H756 370 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NUDT5Q9UKK9 219 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 GSC2O15499 205 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MAP3K13O43283 966 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CYP1A2P05177 515 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 BLMHQ13867 455 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 WDR49Q8IV35 697 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 RNFT2Q96EX2 444 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ERAP1Q9NZ08 941 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 AGRPO00253 132 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 VPS4BO75351 444 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 BANF1O75531 89 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 STRIP1Q5VSL9 837 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 C11orf96Q7Z7L8 435 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CYP4Z1Q86W10 505 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 GANQ9H2C0 597 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PIAS1O75925 651 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 GLP2RO95838 553 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SPEF2Q9C093 1822 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 FEN1P39748 380 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ZNF276Q8N554 614 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PSMA8Q8TAA3 256 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NUAK2Q9H093 628 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 NTSR2O95665 410 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 LTFP02788 710 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CCNA2P20248 432 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ABATP80404 500 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ALLCQ8N6M5 410 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 S100ZQ8WXG8 99 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 BORCS5Q969J3 196 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TMEM176AQ96HP8 235 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 KLHL32Q96NJ5 620 aa10.38□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 AKAP12Q02952 1782 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 DCDC2CA8MYV0 355 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ADSSP30520 456 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 VEPH1Q14D04 833 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 DENND6AQ8IWF6 608 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ACOX2Q99424 681 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 APBA2Q99767 749 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 CLPBQ9H078 707 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SP100P23497 879 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PCDH12Q9NPG4 1184 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PRLP01236 227 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 PRKCIP41743 596 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ARHGEF7Q14155 803 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 C10orf120Q5SQS8 335 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 ARCQ7LC44 396 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 OTUD5Q96G74 571 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 SNAP91O60641 907 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 TADA2AO75478 443 aa10.37□□□□□ -0.75
TTL-201ENST00000233336 MSH3P20585 1137 aa10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms