RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000156342.1

Hoxd3os1-204, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 796 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gpr20Q8BYC4 358 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm13278Q8CD73 182 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Vangl2Q91ZD4 521 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Stard13Q923Q2 1113 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NvlQ9DBY8 855 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ush1cQ9ES64 910 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Prmt1Q9JIF0 371 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Nova1Q9JKN6 507 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 AuhQ9JLZ3 314 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Fam71aB7XG49 585 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 AcadmP45952 421 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Sesn2P58043 480 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rps14P62264 151 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ttc39dQ0VF76 604 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Togaram2Q3TYG6 1002 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 FdxrQ61578 494 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cyp3a13Q64464 503 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Lrig3Q6P1C6 1117 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cand2Q6ZQ73 1235 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ldoc1Q7TPY9 151 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zdhhc6Q9CPV7 413 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Tor1bQ9ER41 336 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Spry4Q9WTP2 300 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Krt16Q9Z2K1 469 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cfap54Q8C6S9 3106 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Atg2bQ80XK6 2075 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Vmn2r94E9PZK8 818 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Tekt5G5E8A8 557 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Nr1i3O35627 358 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 LcatP16301 438 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NsfP46460 744 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gabpb2P81069 414 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Kdm7aQ3UWM4 940 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 MmeQ61391 750 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Tlr13Q6R5N8 991 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rimbp2Q80U40 1072 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Arhgap12Q8C0D4 838 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 AA792892Q8C6S1 278 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 C1raQ8CG16 707 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ift43Q9DA69 206 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Magi2Q9WVQ1 1275 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Adgrf5G5E8Q8 1348 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Olfr316A0A0N4SVP2 306 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm3285A0A1W2P7U0 201 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Olfr742A2RTP5 311 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm16430A6X8J1 155 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm13271B1AYH9 182 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm3488M0QW81 238 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 RdxP26043 583 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 PolgP54099 1218 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Klra9Q2TJJ8 266 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 BC051142Q3V0M8 400 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Fbxo39Q5NBU5 443 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Olfr318Q5NCD7 306 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ints6Q6PCM2 883 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Abcg2Q7TMS5 657 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 NrcamQ810U4 1256 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Vps28Q9D1C8 221 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 BC034090A0A087WP46 1202 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zbtb34A2ATY4 518 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Ccdc8D3YZV8 685 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zfp839E9PUU5 921 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Olfr414E9Q5P8 317 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Xrcc5P27641 732 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Tyro3P55144 880 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Rnf113a2Q14B01 337 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zfp235Q499D5 702 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Gm527Q4KL13 310 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Olfr121Q5CZY0 321 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Slc5a10Q5SWY8 596 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Tdpoz3Q717B4 365 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Olfr1128Q7TR47 311 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Exoc3l1Q8BI71 739 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 CpqQ9WVJ3 470 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Wdfy4E9Q2M9 3149 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Olfr1305A2AVW3 312 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 C87414E9PWI7 475 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Nr2c2P49117 596 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Acvrl1Q61288 502 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Hspa4Q61316 841 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cox8aQ64445 69 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Fam167aQ6P1G6 215 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 TmieQ8K467 153 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Tcte1A6H639 498 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Cnbd1B1AWM0 430 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Lhx3P50481 400 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Zscan2Q07230 614 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 Qsox2Q3TMX7 692 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 RhocQ62159 193 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.5 ms