RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641425.1

CASC19-231, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 1,156 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-231	ENST00000641425	PRRG1	O14668	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CETN3	O15182	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	TBX1	O43435	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	HUS1	O60921	280 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ATP2C2	O75185	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	KIF20A	O95235	890 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	VNN1	O95497	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ODC1	P11926	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	GJA1	P17302	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	PTPN2	P17706	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	NR2F2	P24468	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	FPR2	P25090	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	VAMP7	P51809	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CREM	Q03060	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	TWF1	Q12792	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	GPR17	Q13304	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	BIRC3	Q13489	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MORC3	Q14149	939 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	SV2C	Q496J9	727 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CEP72	Q9P209	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	TRANK1	O15050	2925 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	TECTA	O75443	2155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	GABRD	O14764	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MOSPD3	O75425	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CLSTN1	O94985	981 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	C1R	P00736	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	LRG1	P02750	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	ITGAV	P06756	1048 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	RHO	P08100	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MYL4	P12829	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	KRT13	P13646	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CCNE1	P24864	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CYP2F1	P24903	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	PNPLA4	P41247	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	CCR2	P41597	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	GCLM	P48507	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	GPR15	P49685	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	NFIL3	Q16649	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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