RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605031.5

FOCAD-215, Transcript of focadhesin, human

TSL 4

Gene FOCAD, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FOCAD-215	ENST00000605031	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	NPAT	Q14207	1427 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	EEA1	Q15075	1411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CPS1	P31327	1500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	AP4M1	O00189	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CER1	O95813	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	FGB	P02675	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CREB1	P16220	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ADRA1D	P25100	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ADD2	P35612	726 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	PRKAA2	P54646	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	TPTE	P56180	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	LMAN2	Q12907	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	PRKG1	Q13976	671 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	MECR	Q9BV79	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031		M0QYT0	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CA12	O43570	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ENG	P17813	658 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	FPR3	P25089	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CCT5	P48643	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	MTHFS	P49914	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	DGKQ	P52824	942 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	GPC5	P78333	572 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CSHL1	Q14406	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	TAF5	Q15542	800 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	RITA1	Q96K30	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ABCC1	P33527	1531 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	PREX2	Q70Z35	1606 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031		H0Y3Z8	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	PSMD9	O00233	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	OAZ2	O95190	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CKMT1A	P12532	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	ALAD	P13716	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	DRD1	P21728	446 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	PDE1A	P54750	535 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	FOXL2	P58012	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FOCAD-215	ENST00000605031	CUL4B	Q13620	913 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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