RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602164.5

USF2-215, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, human

TSL 3

Gene USF2, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USF2-215	ENST00000602164	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	CHST9	Q7L1S5	443 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	STRADA	Q7RTN6	431 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	AHI1	Q8N157	1196 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	MCEE	Q96PE7	176 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	DNAJC7	Q99615	494 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	ISCU	Q9H1K1	167 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		27.71	■■■□□ 2.03
USF2-215	ENST00000602164	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	RTN2	O75298	545 aa		27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	WAS	P42768	502 aa		27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	HDAC4	P56524	1084 aa		27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	MAMLD1	Q13495	774 aa		27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CHPF	Q8IZ52	775 aa		27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	EPC1	Q9H2F5	836 aa		27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		27.7	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164		A0A1B0GVM2	712 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	PRR23A	A6NEV1	266 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	HR	O43593	1189 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	HOXB2	P14652	356 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	OGDH	Q02218	1023 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CDH18	Q13634	790 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ZNF234	Q14588	700 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	UCMA	Q8WVF2	138 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	C1orf74	Q96LT6	269 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CIPC	Q9C0C6	399 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	SIK2	Q9H0K1	926 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	NENF	Q9UMX5	172 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	PIEZO1	Q92508	2521 aa		27.69	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	WASH3P	C4AMC7	463 aa		27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	NPC1	O15118	1278 aa		27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	AXIN1	O15169	862 aa		27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CCP110	O43303	1012 aa		27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	TIMM44	O43615	452 aa		27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	IL12RB1	P42701	662 aa		27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	MBLAC2	Q68D91	279 aa		27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ANO7	Q6IWH7	933 aa		27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	HAPLN3	Q96S86	360 aa		27.68	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		27.67	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164		A0A087X0T9	212 aa		27.67	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	FAM228B	P0C875	321 aa		27.67	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CNR2	P34972	360 aa		27.67	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	MRE11	P49959	708 aa		27.67	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	PTPRN	Q16849	979 aa		27.67	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	DRC7	Q8IY82	874 aa		27.67	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	TTC17	Q96AE7	1141 aa		27.67	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	PARVA	Q9NVD7	372 aa		27.67	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	DRGX	A6NNA5	263 aa		27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164		H0Y626	953 aa		27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	MFAP3L	O75121	409 aa		27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ADRA1B	P35368	520 aa		27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ZNF653	Q96CK0	615 aa		27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CNPY3	Q9BT09	278 aa		27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	RAD54B	Q9Y620	910 aa		27.66	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CKAP5	Q14008	2032 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CNTN5	O94779	1100 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	PRKCH	P24723	683 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	ALF	Q53S48	1182 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	SDE2	Q6IQ49	451 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	VPS36	Q86VN1	386 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	CCDC185	Q8N715	623 aa		27.65	■■■□□ 2.02
USF2-215	ENST00000602164	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		27.65	■■■□□ 2.02

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