RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561817.5

CAPN3-210, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPN3, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-210ENST00000561817 ACRP10323 421 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 NCAM1P13591 858 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 GRIK1P39086 918 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 MAGEA6P43360 314 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 VPS41P49754 854 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 DEFB103AP81534 67 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ROR1Q01973 937 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 FPGSQ05932 587 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 GPS1Q13098 491 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 XRCC4Q13426 336 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 MTMR3Q13615 1198 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 MORF4L2Q15014 288 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 DDR2Q16832 855 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 P3H1Q32P28 736 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ODF2Q5BJF6 829 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 EMC10Q5UCC4 262 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 MANEALQ5VSG8 457 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 MFSD5Q6N075 450 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ZNF365Q70YC5 407 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 PCGF5Q86SE9 256 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 NUP93Q8N1F7 819 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 TMEM199Q8N511 208 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 BBOF1Q8ND07 529 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 STKLD1Q8NE28 680 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 RNF139Q8WU17 664 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 CPT1BQ92523 772 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 P3H4Q92791 437 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SLC39A13Q96H72 371 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 IGSF21Q96ID5 467 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SPATA17Q96L03 361 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 TTPALQ9BTX7 342 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 KLC2Q9H0B6 622 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 DDIT4Q9NX09 232 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 DTLQ9NZJ0 730 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 MTRRQ9UBK8 725 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 CEP290O15078 2479 aa6.75□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 WDR27A2RRH5 827 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 E7ESA3 106 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 H3BRJ5 948 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 H7C4K7 107 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SGK1O00141 431 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ALOX15BO15296 676 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 MFSD11O43934 449 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 OPA1O60313 960 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ICMTO60725 284 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SOAT2O75908 522 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 TMEM63AO94886 807 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 SHBGP04278 402 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 VAV1P15498 845 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 CSF2RAP15509 400 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 DESP17661 470 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 ATF6P18850 670 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 RBL1P28749 1068 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 HOXC13P31276 330 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 NR2C2P49116 596 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 RAB15P59190 212 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPN3-210ENST00000561817 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
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