RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 PODXLO00592 558 aa11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SOX9P48436 509 aa11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC12A2P55011 1212 aa11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC25A3Q00325 362 aa11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ATG9AQ7Z3C6 839 aa11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 GALNT12Q8IXK2 581 aa11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 TBX22Q9Y458 520 aa11.3□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 FAM205CA6NFA0 338 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 MYL2P10916 166 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 GRIK1P39086 918 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ACOT2P49753 483 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 MGAT3Q09327 533 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 MFSD13AQ14CX5 517 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CEP68Q76N32 757 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 LILRA2Q8N149 483 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 RMDN3Q96TC7 470 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 PNPLA3Q9NST1 481 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 PSMA7O14818 248 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 KLRC4O43908 158 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ENTPD3O75355 529 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 TGDSO95455 350 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SFTPCP11686 197 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 HERC3Q15034 1050 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SNX7Q9UNH6 387 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 KCNJ14Q9UNX9 436 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 NAV1Q8NEY1 1877 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 PRSS44E7EML9 344 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 I3L4J1 428 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ITGALP20701 1170 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 NDST1P52848 882 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 VAC14Q08AM6 782 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 PDPRQ8NCN5 879 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 MOGAT1Q96PD6 335 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ASB2Q96Q27 587 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CHID1Q9BWS9 393 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM216Q9P0N5 145 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM9Q9P0T7 183 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CDH22Q9UJ99 828 aa11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CCNKO75909 580 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 NOL4O94818 638 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 BMP15O95972 392 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 BCL10O95999 233 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 GCP02774 474 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 KRT8P05787 483 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 HSPA2P54652 639 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SSTP61278 116 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ARSKQ6UWY0 536 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 PRELID2Q8N945 189 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ST8SIA2Q92186 375 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 TRABDQ9H4I3 376 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 BRD7Q9NPI1 651 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 POTEB3A0JP26 581 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 C16orf96A6NNT2 1141 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 TSPAN4O14817 238 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 UGT2B4P06133 528 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CD53P19397 219 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CCNA2P20248 432 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 CA4P22748 312 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 SOX11P35716 441 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 EPHB1P54762 984 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 VBP1P61758 197 aa11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
SEMA4B-204ENST00000558065 POTEBQ6S5H4 581 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms