RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531858.1

AC055878.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC055878.1, Length 281 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC055878.1-201ENST00000531858 ZNF844Q08AG5 666 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 BNIP3Q12983 259 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 FHL3Q13643 280 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 NAA25Q14CX7 972 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TBR1Q16650 682 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 GSTA3Q16772 222 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 ST3GAL2Q16842 350 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TYSND1Q2T9J0 566 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 P3H1Q32P28 736 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TMEM196Q5HYL7 178 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 AGBL4Q5VU57 503 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TTI2Q6NXR4 508 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 KRT27Q7Z3Y8 459 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 SLC15A3Q8IY34 581 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 C11orf65Q8NCR3 313 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 SETD6Q8TBK2 473 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 PERPQ96FX8 193 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TRIB1Q96RU8 372 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 FUT8Q9BYC5 575 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 BCAS3Q9H6U6 928 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 GCM1Q9NP62 436 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 IKBKGQ9Y6K9 419 aa4.59□□□□□ -1.67
AC055878.1-201ENST00000531858 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 A0A0U1RQK1 487 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 ZNF320A2RRD8 509 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 PLOD2O00469 737 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 ASAP2O43150 1006 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 ZBTB14O43829 449 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 TRIM13O60858 407 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 FYNP06241 537 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 PRR35P0CG20 571 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 HGFP14210 728 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 PTPN2P17706 415 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 ITGB5P18084 799 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 ITGALP20701 1170 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 MGAT1P26572 445 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 CIITAP33076 1130 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 THBS4P35443 961 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 NRIP1P48552 1158 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 MTHFSP49914 203 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 STAT2P52630 851 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 ADAM8P78325 824 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 SCN1BQ07699 218 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 KCNB1Q14721 858 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 FBLN7Q53RD9 439 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 ARMC4Q5T2S8 1044 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 ADGRF1Q5T601 910 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 CST9LP1Q5W188 147 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 JADE1Q6IE81 842 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 USP30Q70CQ3 517 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 BTN2A1Q7KYR7 527 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 GPR149Q86SP6 731 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 NLRP14Q86W24 1093 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 SYNE4Q8N205 404 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 DPP10Q8N608 796 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 ANKRD53Q8N9V6 530 aa4.58□□□□□ -1.68
AC055878.1-201ENST00000531858 Q8NFD4 153 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms