RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 BOLA3Q53S33 107 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ALFQ53S48 1182 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 MPP7Q5T2T1 576 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 MFN1Q8IWA4 741 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 FLCNQ8NFG4 579 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 TEKT4Q8WW24 435 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 CD101Q93033 1021 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 TBC1D31Q96DN5 1066 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 MSANTD3Q96H12 275 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 PNKPQ96T60 521 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 EPAS1Q99814 870 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 FOXQ1Q9C009 403 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 DEC1Q9P2X7 70 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.11□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GVM2 712 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM221A6NGB7 291 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 DRGXA6NNA5 263 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 M0R296 226 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 DAPK3O43293 454 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 KAT7O95251 611 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 EGFP01133 1207 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 KRT7P08729 469 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 GOT1P17174 413 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 EPHB2P29323 1055 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 HLA-FP30511 346 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 NUMBP49757 651 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 CDH4P55283 916 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 CDH6P55285 790 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 STARD6P59095 220 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 TPI1P60174 286 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 SEMA3BQ13214 749 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 KRT81Q14533 505 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 DPYSL2Q16555 572 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 C5orf22Q49AR2 442 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 FSCBQ5H9T9 825 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ARTNQ5T4W7 220 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 MANEALQ5VSG8 457 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 CHST9Q7L1S5 443 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 KCTD6Q8NC69 237 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 EXOC4Q96A65 974 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ZYG11BQ9C0D3 744 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 NEU3Q9UQ49 428 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.1□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.09□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 TBC1D3BA6NDS4 549 aa9.09□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.09□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 FAM170BA6NMN3 283 aa9.09□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 H3BRJ5 948 aa9.09□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 ZSCAN12O43309 604 aa9.09□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 CLDN11O75508 207 aa9.09□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 FTCDO95954 541 aa9.09□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 KRT1P04264 644 aa9.09□□□□□ -0.95
CASQ1-202ENST00000467691 APODP05090 189 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms