RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448303.5

RBM39-217, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 5

Gene RBM39, Length 1,008 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-217ENST00000448303 TFCP2Q12800 502 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 PPFIA1Q13136 1202 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 DRP2Q13474 957 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 PLCB4Q15147 1175 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ALX1Q15699 326 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 TTLL5Q6EMB2 1281 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 TAPT1Q6NXT6 567 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 SHC4Q6S5L8 630 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 LRRC55Q6ZSA7 311 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ZNF280BQ86YH2 543 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 TMTC2Q8N394 836 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 PSD4Q8NDX1 1056 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.591e-8■■■■□ 25.8
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RBM39-217ENST00000448303 EDAQ92838 391 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 LRRC46Q96FV0 321 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 NUP58Q9BVL2 599 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 MAGEH1Q9H213 219 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 RNPEPQ9H4A4 650 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 AS3MTQ9HBK9 375 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 PDE11AQ9HCR9 933 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 INTS13Q9NVM9 706 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 RMND1Q9NWS8 449 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 MAN1B1Q9UKM7 699 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 CDYLQ9Y232 598 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 RAD54BQ9Y620 910 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 MYH4Q9Y623 1939 aa5.13□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 NUP98P52948 1817 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 CAPN14A8MX76 684 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 EYA2O00167 538 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ZNF213O14771 459 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ZNF185O15231 689 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 CYP27B1O15528 508 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
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RBM39-217ENST00000448303 ITGA5P08648 1049 aa5.12□□□□□ -1.59
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RBM39-217ENST00000448303 KCNA2P16389 499 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 PRLRP16471 622 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 IFNAR1P17181 557 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 FGFR4P22455 802 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 LRPAP1P30533 357 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ARHGAP25P42331 645 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 MAN2A2P49641 1150 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 DGKEP52429 567 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ZNF134P52741 427 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 KRT83P78385 493 aa5.12□□□□□ -1.59
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RBM39-217ENST00000448303 POU5F1BQ06416 359 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 PNOCQ13519 176 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ZNF569Q5MCW4 686 aa5.12□□□□□ -1.59
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RBM39-217ENST00000448303 MAF1Q9H063 256 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ZSCAN32Q9NX65 697 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 RNF14Q9UBS8 474 aa5.12□□□□□ -1.59
RBM39-217ENST00000448303 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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