RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM38O00635 465 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 IKBKBO14920 756 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SIGLEC6O43699 453 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 ZBED1O96006 694 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SLFN14P0C7P3 912 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 UCNP55089 124 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 ST8SIA6P61647 398 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 PPP2CBP62714 309 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 PPP2CAP67775 309 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 AADATQ8N5Z0 425 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 EDEM1Q92611 657 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 HECTD1Q9ULT8 2610 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TULP2O00295 520 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 KLK10O43240 276 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 LATS1O95835 1130 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SYT1P21579 422 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 ADPRHP54922 357 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 CUL4BQ13620 913 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 RNF139Q8WU17 664 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 FAM129BQ96TA1 746 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 STIM2Q9P246 746 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TTC34A8MYJ7 566 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SLC28A2O43868 658 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 GOT1P17174 413 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 PDCP20941 246 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SLC6A4P31645 630 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 CSKP41240 450 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 PSMD8P48556 350 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 GABREP78334 506 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 VAC14Q08AM6 782 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 STK38Q15208 465 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 MPP7Q5T2T1 576 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 CEP135Q66GS9 1140 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SHC4Q6S5L8 630 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A45Q8N413 288 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXD12-201ENST00000404162 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 LATO43561 262 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 NR3C1P04150 777 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ASLP04424 464 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 AFMP43652 599 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 GCLMP48507 274 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 VAMP7P51809 220 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 DAB2P98082 770 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 PPP3CAQ08209 521 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 STK4Q13043 487 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 CUL4AQ13619 759 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 MFN1Q8IWA4 741 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 FIBINQ8TAL6 211 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 MED8Q96G25 268 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 YJEFN3A6XGL0 299 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 E7ENQ6 273 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 SPTLC2O15270 562 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 USP12O75317 370 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 DXOO77932 396 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM49P0CI25 452 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM49CP0CI26 452 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 RAD23BP54727 409 aa20■□□□□ 0.79
HOXD12-201ENST00000404162 ARID5BQ14865 1188 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms