RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 CCNA2P20248 432 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ITGAXP20702 1163 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 NAMPTP43490 491 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 MARCKSL1P49006 195 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 COPAP53621 1224 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GHRHRQ02643 423 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GALNT3Q14435 633 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TEX44Q53QW1 395 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 DSG4Q86SJ6 1040 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 OR13F1Q8NGS4 319 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TTC17Q96AE7 1141 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ASIC4Q96FT7 647 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CFAP36Q96G28 342 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 KCNK16Q96T55 309 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 HMG20AQ9NP66 347 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 C8orf4Q9NR00 106 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GIPC1O14908 333 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SNNO75324 88 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ALDH1A2O94788 518 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 OLFM2O95897 454 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 KRT15P19012 456 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GRIA3P42263 894 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 KCNJ1P48048 391 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PMS2P3Q13401 168 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ERAP2Q6P179 960 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 MFSD4AQ8N468 514 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 S100ZQ8WXG8 99 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ASB2Q96Q27 587 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 PCM1Q15154 2024 aa7.56□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 A0A0B4J203 849 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 MTSS1O43312 755 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ATF2P15336 505 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 RRM1P23921 792 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 OPRL1P41146 370 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CASP3P42574 277 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 OR3A3P47888 321 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 CLCNKBP51801 687 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 HERC3Q15034 1050 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 HPS6Q86YV9 775 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TTLL6Q8N841 843 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 C9orf72Q96LT7 481 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TM9SF2Q99805 663 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TAS2R7Q9NYW3 318 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ISPDA4D126 451 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 MEI4A8MW99 385 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 TAF4O00268 1085 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 ASNA1O43681 348 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 GDF11O95390 407 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 MYL4P12829 197 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 BMP1P13497 986 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 NUBP1P53384 320 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SNAP25P60880 206 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 IKBKEQ14164 716 aa7.55□□□□□ -1.2
GTF2E1-201ENST00000283875 SNX17Q15036 470 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms