RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.01□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 KRT78Q8N1N4 520 aa8□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 C4orf22Q6V702 233 aa8□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 TERB1Q8NA31 727 aa8□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PQ67 120 aa8□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 21.5
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USP3-201ENST00000268049 CLPTM1O96005 669 aa8□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 JUPP14923 745 aa8□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 C4BPBP20851 252 aa8□□□□□ -1.13
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USP3-201ENST00000268049 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.131e-15■■■■■ 33.6
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USP3-201ENST00000268049 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.131e-7■■■□□ 14.6
USP3-201ENST00000268049 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.99□□□□□ -1.13
USP3-201ENST00000268049 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.99□□□□□ -1.13
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