RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 PMPCBO75439 489 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 HLA-DPA1P20036 260 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SERPINB1P30740 379 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 BNIP2Q12982 314 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ELOVL6Q9H5J4 265 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.22□□□□□ -0.93
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PTPRB-201ENST00000261266 COPG2Q9UBF2 871 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 FAM86B1E9PN63 330 aa9.22□□□□□ -0.93
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PTPRB-201ENST00000261266 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CXCL8P10145 99 aa9.22□□□□□ -0.93
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PTPRB-201ENST00000261266 SMIM11AP58511 58 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SPG21Q9NZD8 308 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 IRGMA1A4Y4 181 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 LTFP02788 710 aa9.22□□□□□ -0.93
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PTPRB-201ENST00000261266 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ATP6V0D1P61421 351 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 DPYSL3Q14195 570 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM26Q6ZUK4 368 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 EID3Q8N140 333 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CPB2Q96IY4 423 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 RGS18Q9NS28 235 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SPASTQ9UBP0 616 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 UQCRBP14927 111 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 PTPRAP18433 802 aa9.22□□□□□ -0.93
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PTPRB-201ENST00000261266 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 KCNJ1P48048 391 aa9.22□□□□□ -0.93
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PTPRB-201ENST00000261266 APBA2Q99767 749 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 KCTD10Q9H3F6 313 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SUFUQ9UMX1 484 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.22□□□□□ -0.93
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PTPRB-201ENST00000261266 SGTAO43765 313 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CAND2O75155 1236 aa9.22□□□□□ -0.93
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PTPRB-201ENST00000261266 EFEMP1Q12805 493 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 MMRN1Q13201 1228 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ACTL9Q8TC94 416 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 DPY30Q9C005 99 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SNTG2Q9NY99 539 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 STK25O00506 426 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 FSBPO95073 299 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 TGDSO95455 350 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SERPINA4P29622 427 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 PPM1AP35813 382 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 SLC34A1Q06495 639 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 PSMD5Q16401 504 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 NEK5Q6P3R8 708 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRB-201ENST00000261266 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
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