RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Armt1A6H630 439 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NuggcD3YWJ0 796 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10722F6VLK5 217 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SmgcF6VRN1 385 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r39G3UWE6 305 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Edil3O35474 480 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hcn3O88705 779 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp6v0d1P51863 351 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 UtyP79457 1212 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TchpQ3TVW5 497 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam129aQ3UW53 926 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp956Q3UZY6 572 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 9930111J21Rik1Q5SVP0 844 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr792Q7TRH9 311 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap25Q8BYW1 648 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ClmnQ8C5W0 1052 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc63Q8CDV6 558 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc22a19Q8VCA0 551 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nsmce2Q91VT1 247 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adcy4Q91WF3 1077 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prkag2Q91WG5 566 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zdhhc7Q91WU6 308 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cog2Q921L5 731 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt5Q922U2 580 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcp2Q9CYC6 422 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PirQ9D711 290 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc29a1Q9JIM1 460 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tdp2Q9JJX7 370 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acox2Q9QXD1 681 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpv2Q9WTR1 756 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ern2Q9Z2E3 911 aa6.77□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pold2O35654 469 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mmp10O55123 476 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hcn4O70507 1186 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alas2P08680 587 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Crabp2P22935 138 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NrlP54846 237 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Morf4l1P60762 362 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Polr1bP70700 1135 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prdx5P99029 210 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gdf3Q07104 366 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxo39Q5NBU5 443 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exoc3l4Q6DIA2 721 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chst10Q6PGK7 356 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam181bQ80VF6 417 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pggt1bQ8BUY9 377 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AA792892Q8C6S1 278 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zdhhc3Q8R173 299 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam114a2Q8VE88 497 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BsndQ8VIM4 307 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pex6Q99LC9 981 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 KlbQ99N32 1043 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc30bQ9CY00 664 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cab39lQ9DB16 337 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pgam1Q9DBJ1 254 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp11cQ9QZW0 1129 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nme3Q9WV85 169 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 A630010A05RikA9C473 232 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plekha5E9Q6H8 1269 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 2610028H24RikG5E8K1 270 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Top6blJ3QMY9 579 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cops5O35864 334 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pknox1O70477 436 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnmt3bO88509 859 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Impdh2P24547 514 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ckmt1P30275 418 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Elk4P41158 430 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AcadsQ07417 412 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptpn14Q62130 1189 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prl3a1Q78Y73 227 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1057Q7TR75 315 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr798Q7TRH8 311 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kansl2Q8BQR4 486 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cops7bQ8BV13 264 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wwp1Q8BZZ3 918 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim32Q8CH72 655 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plbd1Q8VCI0 550 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Evi2bQ8VD58 444 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxo33Q8VE08 562 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ak5Q920P5 562 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nmd3Q99L48 503 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcyox1Q9CQF9 505 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr45Q9EQQ4 373 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itgb1bp2Q9R000 350 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3173A6NAS3 172 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3020E9Q3J7 150 aa6.76□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm2897K7N6T7 172 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.9 ms