RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF276Q8N554 614 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 MREGQ8N565 214 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 AFAP1L1Q8TED9 768 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 KIFAP3Q92845 792 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 SLC35C1Q96A29 364 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 PGBD4Q96DM1 585 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 CAPZA3Q96KX2 299 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 AGAP2Q99490 1192 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 SOX7Q9BT81 388 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 TTPALQ9BTX7 342 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 TLR10Q9BXR5 811 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRM-215ENST00000583289 GANQ9H2C0 597 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 LCMT1Q9UIC8 334 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 AMFRQ9UKV5 643 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRM-215ENST00000583289 PSME4Q14997 1843 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 MYPNQ86TC9 1320 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 A0A087X0T9 212 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRM-215ENST00000583289 TCP10L2B9ZVM9 353 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 C19orf81C9J6K1 198 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 TGFB1I1O43294 461 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRM-215ENST00000583289 SRGAP2O75044 1071 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRM-215ENST00000583289 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
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PTPRM-215ENST00000583289 RECQL4O94761 1208 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRM-215ENST00000583289 GAAP10253 952 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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PTPRM-215ENST00000583289 ZG16BQ96DA0 208 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRM-215ENST00000583289 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRM-215ENST00000583289 VPS18Q9P253 973 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRM-215ENST00000583289 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 MYH11P35749 1972 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SLX4Q8IY92 1834 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 KIF13BQ9NQT8 1826 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ASTN1O14525 1302 aa4.82□□□□□ -1.64
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