RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 TRIM49BA6NDI0 452 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 M0QYV0 167 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PIK3R2O00459 728 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ACSL4O60488 711 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 LTFP02788 710 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 DNTTP04053 509 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ACSL1P33121 698 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TBX4P57082 545 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ST8SIA6P61647 398 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RING1Q06587 406 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ISM2Q6H9L7 571 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 MSANTD2Q6P1R3 559 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RFWD3Q6PCD5 774 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RRAGAQ7L523 313 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CACUL1Q86Y37 369 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 UBR7Q8N806 425 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 FIBINQ8TAL6 211 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 GANCQ8TET4 914 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PHF12Q96QT6 1004 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CDC6Q99741 560 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 IL21RQ9HBE5 538 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ST7Q9NRC1 585 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 STIM2Q9P246 746 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 FRYQ5TBA9 3013 aa8.48□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 IGF2RP11717 2491 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CACNA1GO43497 2377 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 BICDL2A1A5D9 508 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 P4HA2O15460 535 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CBFA2T3O75081 653 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 FSBPO95073 299 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SEMA4FO95754 770 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 IGLV3-27P01718 113 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ASLP04424 464 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CD27P26842 260 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SLC6A4P31645 630 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CD70P32970 193 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SGSHP51688 502 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 NUCB2P80303 420 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 BNC1Q01954 994 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 GCNT1Q02742 428 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 BECN1Q14457 450 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PTPRNQ16849 979 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 GLRX5Q86SX6 157 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 MFN1Q8IWA4 741 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ZNF366Q8N895 744 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 LMO3Q8TAP4 145 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SLC39A7Q92504 469 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TTC17Q96AE7 1141 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SKA1Q96BD8 255 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SERPINB11Q96P15 392 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 MIS12Q9H081 205 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SGK2Q9HBY8 427 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 SCML1Q9UN30 329 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 PI4KAP42356 2102 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.47□□□□□ -1.05
COCH-211ENST00000557065 CAPN9O14815 690 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FLRT2O43155 660 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MED7O43513 233 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 DFNA5O60443 496 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MOCS3O95396 460 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 GNA14O95837 355 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CSKP41240 450 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 GPD2P43304 727 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ACADSBP45954 432 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 GRIA4P48058 902 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KCNH2Q12809 1159 aa8.46□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KIF19Q2TAC6 998 aa8.46□□□□□ -1.06
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