RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM221	A6NGB7	291 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552		M0R296	226 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	MSH4	O15457	936 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	REC8	O95072	547 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	VTN	P04004	478 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	C5AR1	P21730	350 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	RPS6KB1	P23443	525 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CYP3A7	P24462	503 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PSMA5	P28066	241 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CRHR1	P34998	444 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	WAS	P42768	502 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	RAB27A	P51159	221 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CLCN3	P51790	818 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ITIH3	Q06033	890 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	FOXL1	Q12952	345 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	GIT2	Q14161	759 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	GALNT17	Q6IS24	598 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF410	Q86VK4	478 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	CASP10	Q92851	521 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ARL8A	Q96BM9	186 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	SPG21	Q9NZD8	308 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PDE4D-222	ENST00000514552	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	PSMD10	O75832	226 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	COMT	P21964	271 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	ECHS1	P30084	290 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CASR	P41180	1078 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	MGAT2	Q10469	447 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	HS1BP3	Q53T59	392 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	XKR3	Q5GH77	459 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	PPM1N	Q8N819	430 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	BORCS6	Q96GS4	357 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	MBOAT7	Q96N66	472 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	S1PR5	Q9H228	398 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	BCO1	Q9HAY6	547 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CACNA1A	O00555	2505 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	EVPL	Q92817	2033 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	FRYL	O94915	3013 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	WDR81	Q562E7	1941 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	ITGA10	O75578	1167 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	DEXI	O95424	95 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	TEC	P42680	631 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	MTHFR	P42898	656 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	GZMK	P49863	264 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC16A1	P53985	500 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	EFEMP1	Q12805	493 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	ODF1	Q14990	250 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	CES5A	Q6NT32	575 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PDE4D-222	ENST00000514552	D2HGDH	Q8N465	521 aa		7.51	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms