RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 COX11Q9Y6N1 276 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TOR1BO14657 336 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CA12O43570 354 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 EDIL3O43854 480 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TLR2O60603 784 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 POLR2MP0CAP2 368 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KCNA2P16389 499 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CTGFP29279 349 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 GNA11P29992 359 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 OAZ1P54368 228 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 RPS6P62753 249 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 NUCB2P80303 420 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 C17orf99Q6UX52 265 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF365Q70YC5 407 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 LNX2Q8N448 690 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 IL31RAQ8NI17 732 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TBCKQ8TEA7 893 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 GJA10Q969M2 543 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ACAD9Q9H845 621 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CNPY2Q9Y2B0 182 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CLIC4Q9Y696 253 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0G2JMZ2 1700 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KAT6AQ92794 2004 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ESYT2A0FGR8 921 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 GABRDO14764 452 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MGST3O14880 152 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ATP2A1O14983 1001 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 FIBPO43427 364 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF10O60809 474 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TDP2O95551 362 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 C1RP00736 705 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MAP2K2P36507 400 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 C21orf58P58505 322 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KRT85P78386 507 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CCNA1P78396 465 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TLE1Q04724 770 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 FPGSQ05932 587 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KCTD2Q14681 263 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 PTPN21Q16825 1174 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 LETM2Q2VYF4 491 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 GPR142Q7Z601 462 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 BICD2Q8TD16 824 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 USP28Q96RU2 1077 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 RMDN3Q96TC7 470 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 IMPG2Q9BZV3 1241 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 INTS13Q9NVM9 706 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CYP39A1Q9NYL5 469 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 MORF4L1Q9UBU8 362 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 TCHHQ07283 1943 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRC-211ENST00000484135 ASTN1O14525 1302 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MYH7BA7E2Y1 1941 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PS29 197 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 YY2O15391 372 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SLC43A1O75387 559 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 BAG4O95429 457 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A27O95847 323 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CYP2B6P20813 491 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CCND1P24385 295 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 EDNRBP24530 442 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ADORA2AP29274 412 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PSMC4P43686 418 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 RARRES1P49788 294 aa5.27□□□□□ -1.57
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