RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZSWIM3Q96MP5 696 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 NIPAL2Q9H841 368 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ABCB9Q9NP78 766 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 MYH15Q9Y2K3 1946 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM210A6NLX4 147 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 NUAK1O60285 661 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TSPAN19P0C672 248 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ITGA2P17301 1181 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRKACAP17612 351 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FASP25445 335 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RPS5P46782 204 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 HLCSP50747 726 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ART3Q13508 389 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRIP10Q15642 601 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 HMGN3Q15651 99 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CHSY1Q86X52 802 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KAT2AQ92830 837 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF333Q96JL9 665 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 VPS28Q9UK41 221 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A1W2PP64 1363 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TADA2AO75478 443 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCNKO75909 580 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRKD3O94806 890 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LDHAP00338 332 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FGFR4P22455 802 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PIK3R1P27986 724 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SEPHS1P49903 392 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 HK3P52790 923 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FGL1Q08830 312 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRAF3Q13114 568 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GRM2Q14416 872 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PTPAQ15257 358 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LDLRAP1Q5SW96 308 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CYP4F22Q6NT55 531 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TC2NQ8N9U0 490 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 OCSTAMPQ9BR26 566 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SETD4Q9NVD3 440 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ADAP00813 363 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 IFNA10P01566 189 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FCER2P06734 321 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SMIM6P0DI80 62 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 RRM1P23921 792 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCNE1P24864 410 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 GPR143P51810 404 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARL4CP56559 192 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TEFQ10587 303 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 NFIAQ12857 509 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 USP10Q14694 798 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CRY1Q16526 586 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PTPN21Q16825 1174 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PGM2L1Q6PCE3 622 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KDELC1Q6UW63 502 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 CCDC185Q8N715 623 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.52□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TET3O43151 1660 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 EYA2O00167 538 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCNK3O14649 394 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLITRK3O94933 977 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 NR3C2P08235 984 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PPP3CBP16298 524 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 NOS3P29474 1203 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 MMRN1Q13201 1228 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 SLC9A4Q6AI14 798 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 C16orf46Q6P387 395 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 PLET1Q6UQ28 207 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 KDELC2Q7Z4H8 507 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 MICU3Q86XE3 530 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 ALG1Q9BT22 464 aa3.51□□□□□ -1.85
PKHD1L1-201ENST00000378402 TRMOQ9BU70 441 aa3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms