RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PRDM8Q9NQV8 689 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 KIF17Q9P2E2 1029 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 KIF28PB7ZC32 967 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ADAM10O14672 748 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNAB3O43448 404 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CREB3O43889 395 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CBFA2T3O75081 653 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TAF5LO75529 589 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CER1O95813 267 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 DHRS4L1P0CG22 281 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CST5P28325 142 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 VPS41P49754 854 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CDK7P50613 346 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ARL4CP56559 192 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GPC5P78333 572 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PPFIA1Q13136 1202 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GRM4Q14833 912 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIM60Q495X7 471 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 AWAT2Q6E213 333 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ACSM6Q6P461 480 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 C2CD5Q86YS7 1000 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 NRACQ8N912 160 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 FSIP1Q8NA03 581 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GCC1Q96CN9 775 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PIGSQ96S52 555 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 FZD4Q9ULV1 537 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 VPS4AQ9UN37 437 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 CLIC1O00299 241 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FYB1O15117 783 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 NKX2-8O15522 239 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 PRAMEF2O60811 474 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ALADP13716 330 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TNNT1P13805 278 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 GYS1P13807 737 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFS1P28331 727 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TAS2R50P59544 299 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ACTR2P61160 394 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 DEUP1Q05D60 604 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 AAK1Q2M2I8 961 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TTC22Q5TAA0 569 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 LIN54Q6MZP7 749 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 AFG1LQ8WV93 481 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 KAT2BQ92831 832 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 CUL5Q93034 780 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 NUAK2Q9H093 628 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 NOD2Q9HC29 1040 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 VPS45Q9NRW7 570 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC38A8A6NNN8 435 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 H0Y3Z8 333 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 H3BNC9 293 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 DSCR3O14972 297 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD3E-201ENST00000362899 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms