RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 GCNT1Q02742 428 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CTXN3Q4LDR2 81 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TPD52L3Q96J77 140 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKCQQ04759 706 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PPATQ06203 517 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TBL1YQ9BQ87 522 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKD2Q9BZL6 878 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 EHD4Q9H223 541 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CPS1P31327 1500 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 AMPD1P23109 780 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIK3Q13003 919 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CASP12Q6UXS9 341 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHX4Q8IUS5 362 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PYDC1Q8WXC3 89 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 KAZALD1Q96I82 304 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A087WZ62 844 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 GRK3P35626 688 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 NFIAQ12857 509 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MFSD4BQ5TF39 518 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ASZ1Q8WWH4 475 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35C1Q96A29 364 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CHST7Q9NS84 486 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC167Q9P0B6 97 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPC4Q9UBN4 977 aa24.67■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 THP07101 528 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 DHRSXQ8N5I4 330 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 HASPINQ8TF76 798 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPTQ96BT3 561 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP2K7O14733 419 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGB6P18564 788 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFRSF8P28908 595 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 GSSP48637 474 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPK10P53779 464 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF470Q6ECI4 717 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 OR56A4Q8NGH8 313 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 APBA2Q99767 749 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD51BO15315 384 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CCR1P32246 355 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 EDEM1Q92611 657 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 COQ7Q99807 217 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TRHDEQ9UKU6 1024 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 LTFP02788 710 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAF3Q13114 568 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3BP4Q9P0V3 963 aa24.66■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ALOX12P18054 663 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3R1P27986 724 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 HK2P52789 917 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ADARP55265 1226 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ETNPPLQ8TBG4 499 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD18Q9NS91 495 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 STK39Q9UEW8 545 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA2Q9UM82 520 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SPTLC1O15269 473 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ADIGQ0VDE8 80 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 DPYSL3Q14195 570 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIP2Q9C0E4 1043 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A087WXM4 84 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PRR23AA6NEV1 266 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPXA8MT69 81 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 HACD1B0YJ81 288 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC22BO75396 215 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 VCLP18206 1134 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A23Q9BV35 468 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TMX2Q9Y320 296 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TSNQ15631 228 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CKAP2Q8WWK9 683 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MED8Q96G25 268 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.65■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 VAPBO95292 243 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 FYNP06241 537 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 DSG3P32926 999 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TMC7Q7Z402 723 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ITFG1Q8TB96 612 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms