RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 THP07101 528 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 CTSHP09668 335 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 USP17L7P0C7H9 530 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 SERPINB3P29508 390 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 CRHR1P34998 444 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 LHX1P48742 406 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 ZBTB16Q05516 673 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 CHI3L2Q15782 390 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 CYS1Q717R9 158 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 C3orf58Q8NDZ4 430 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 ZMIZ2Q8NF64 920 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 ARNTL2Q8WYA1 636 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 E2F7Q96AV8 911 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 APBA2Q99767 749 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 SYBUQ9NX95 663 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 TRPV2Q9Y5S1 764 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 AMHP03971 560 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 NCAM1P13591 858 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 ERCC2P18074 760 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 PGAM1P18669 254 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 CCND1P24385 295 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 EPHB2P29323 1055 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 HUNKP57058 714 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 NIPAL4Q0D2K0 466 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 BST1Q10588 318 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 CRYMQ14894 314 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 CES4AQ5XG92 561 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 ATG16L1Q676U5 607 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 TIFABQ6ZNK6 161 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 NUDCD3Q8IVD9 361 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 TMEM86AQ8N2M4 240 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 SKA1Q96BD8 255 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 SIRPGQ9P1W8 387 aa19.78■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 I6L893 689 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 KCNK1O00180 336 aa19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 MYL2P10916 166 aa19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 CNTFP26441 200 aa19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 TPI1P60174 286 aa19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 PID1Q7Z2X4 250 aa19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 CCDC91Q7Z6B0 441 aa19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 SLC9A7Q96T83 725 aa19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 ARL8BQ9NVJ2 186 aa19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa19.77■□□□□ 0.76
USP21-201ENST00000289865 CASTOR2A6NHX0 329 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 PTPN4P29074 926 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 OLIG2Q13516 323 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 CST9Q5W186 159 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 STKLD1Q8NE28 680 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 CDKL2Q92772 493 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 NTAN1Q96AB6 310 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 CNGB3Q9NQW8 809 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 DDIT4Q9NX09 232 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 IGSF9Q9P2J2 1179 aa19.77■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 CENPFP49454 3210 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 DNAJC6O75061 913 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 WFS1O76024 890 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 LTFP02788 710 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 AKR1A1P14550 325 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 SCNN1GP51170 649 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 ACCSLQ4AC99 568 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 PACS1Q6VY07 963 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 CCNJLQ8IV13 435 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 FAM13CQ8NE31 585 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 C7orf26Q96N11 449 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 FBXW11Q9UKB1 542 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 ARL5CA6NH57 179 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 C9IYK1 514 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 BPGMP07738 259 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 PTPN3P26045 913 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 AIF1P55008 147 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 GJA9P57773 515 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 IRX4P78413 519 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 SCAPQ12770 1279 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 SEMA3BQ13214 749 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 TEX44Q53QW1 395 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 RAB41Q5JT25 222 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 CES3Q6UWW8 571 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 EDEM1Q92611 657 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 PAAF1Q9BRP4 392 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 MCM8Q9UJA3 840 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 CDH9Q9ULB4 789 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 PSAT1Q9Y617 370 aa19.76■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
USP21-201ENST00000289865 OCRLQ01968 901 aa19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms