RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 GIPC3Q8TF64 312 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 EGFL8Q99944 293 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 RERGLQ9H628 205 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 LRRC42Q9Y546 428 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 AP3B1O00203 1094 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 PEX10O60683 326 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 AMHP03971 560 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MAPTP10636 758 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 GRIA1P42261 906 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 GTF2H3Q13889 308 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MTX3Q5HYI7 312 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MON1BQ7L1V2 547 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 BANPQ8N9N5 519 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 CDH22Q9UJ99 828 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 HEATR9A2RTY3 570 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 FAM149AA5PLN7 773 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 VDRP11473 427 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MUTP22033 750 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 AKT1S1Q96B36 256 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 AP4S1Q9Y587 144 aa16.08■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 SIGLEC16A6NMB1 481 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MRASO14807 208 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 ATP6V1B2P21281 511 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 C21orf59P57076 290 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 LAMC2Q13753 1193 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 PDK2Q15119 407 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 WDR49Q8IV35 697 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 ARL10Q8N8L6 244 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 FAM47BQ8NA70 645 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 RNF157Q96PX1 679 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 RUBCNLQ9H714 662 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 ITGA2BP08514 1039 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MPSTP25325 297 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 HSD17B4P51659 736 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 GPX6P59796 221 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 IMPG1Q17R60 797 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 IER5Q5VY09 327 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 TFAP2BQ92481 460 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MIPEPQ99797 713 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 SPATA16Q9BXB7 569 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 DAB1O75553 588 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 TM4SF1P30408 202 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 FDFT1P37268 417 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 ULK4Q96C45 1275 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 BRD8Q9H0E9 1235 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 COL20A1Q9P218 1284 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 DSEQ9UL01 958 aa16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 B4GALT5O43286 388 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 GMPRP36959 345 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 DMPKQ09013 629 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 DLG2Q15700 870 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 UGP2Q16851 508 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 KCNMB4Q86W47 210 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 TREML1Q86YW5 311 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 APPL2Q8NEU8 664 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 GPRASP2Q96D09 838 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 NUDT5Q9UKK9 219 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 E5RI56 91 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MAGP20916 626 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.06■□□□□ 0.16
USP43-201ENST00000285199 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms