RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000103133.3

Smarce1-201, Transcript of SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smarce1, Length 2,919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Lilra5D3Z7A9 295 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 ZfxP17012 799 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Ndufs6P52503 116 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Psmc1P62192 440 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Mif4gdQ3UBZ5 222 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Tars2Q3UQ84 723 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Slc24a5Q8C261 501 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Gpc5Q8CAL5 572 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Tmem206Q9D771 350 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Piwil1Q9JMB7 862 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 B4galt5Q9JMK0 388 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Ror1Q9Z139 937 aa14.77□□□□□ -0.04
Smarce1-201ENSMUST00000103133 A0A1Y7VP24 259 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Ptk2P34152 1090 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Slc1a2P43006 572 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Matn1P51942 500 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Dlg3P70175 849 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Lypla1P97823 230 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 AcadsQ07417 412 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Syt15Q8C6N3 418 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 PompQ9CQT5 141 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Dcun1d1Q9QZ73 259 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Trpc3Q9QZC1 836 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Morc1Q9WVL5 950 aa14.77□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Tmem131O70472 1877 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Lrrc23O35125 340 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Cyp2j6O54750 501 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Fzd1O70421 642 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Hoxa2P31245 372 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 DmpkP54265 631 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Tgm6Q8BM11 706 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Atp6v1g3Q8BMC1 118 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Ferd3lQ923Z4 168 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Dctn2Q99KJ8 402 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Pold3Q9EQ28 462 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Trip11E9Q512 1976 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Smok3cA0A087WSF2 504 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Zfp94E9Q6Y4 486 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Gm8882E9Q7E4 283 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Pik3r2O08908 722 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Aff2O55112 1272 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Ephx2P34914 554 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Hoxb13P70321 286 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Tfdp1Q08639 410 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Olfr670Q7TRP3 312 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Nipal4Q8BZF2 406 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Rfx6Q8C7R7 927 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 ClyblQ8R4N0 338 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Lypd3Q91YK8 363 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Nek8Q91ZR4 698 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Cpt1bQ924X2 772 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Sntg2Q925E0 539 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Me2Q99KE1 589 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Satl1Q9D5N8 744 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 GclmO09172 274 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Nek2O35942 443 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 S100bP50114 92 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Atp6v1b2P62814 511 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Pcnx4Q3UVY5 1174 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Prkaa1Q5EG47 559 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Rad51cQ924H5 366 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Copg2Q9QXK3 871 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Tagln3Q9R1Q8 199 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 RecqlQ9Z129 648 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Vmn2r25W4VSP2 855 aa14.76□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Serpinb3cA2RSF9 386 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Drg1P32233 367 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 ItgavP43406 1044 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Stt3aP46978 705 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 RenbpP82343 430 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Lrrc74bQ14BP6 391 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Cfap206Q6PE87 622 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Znf507Q6ZPY5 941 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Mfn1Q811U4 741 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Fbxo44Q8BK26 255 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Atg16l1Q8C0J2 607 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Agbl2Q8CDK2 862 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Rmnd1Q8CI78 450 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 HscbQ8K3A0 234 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Tspan8Q8R3G9 235 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Rnf112Q96DY5 654 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 MceeQ9D1I5 178 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Oma1Q9D8H7 521 aa14.75□□□□□ -0.05
Smarce1-201ENSMUST00000103133 Spock2Q9ER58 423 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.8 ms