Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Tfdp1Q08639 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Tfdp1Q08639 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Tfdp1Q08639 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Tfdp1Q08639 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Tfdp1Q08639 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Tfdp1Q08639 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Tfdp1Q08639 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Tfdp1Q08639 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Tfdp1Q08639 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Tfdp1Q08639 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Tfdp1Q08639 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tfdp1Q08639 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Tfdp1Q08639 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Tfdp1Q08639 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Tfdp1Q08639 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Tfdp1Q08639 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tfdp1Q08639 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Tfdp1Q08639 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tfdp1Q08639 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tfdp1Q08639 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Tfdp1Q08639 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Tfdp1Q08639 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Tfdp1Q08639 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tfdp1Q08639 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tfdp1Q08639 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tfdp1Q08639 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Tfdp1Q08639 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Tfdp1Q08639 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tfdp1Q08639 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tfdp1Q08639 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tfdp1Q08639 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tfdp1Q08639 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tfdp1Q08639 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tfdp1Q08639 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tfdp1Q08639 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tfdp1Q08639 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Tfdp1Q08639 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Tfdp1Q08639 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Tfdp1Q08639 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Tfdp1Q08639 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Tfdp1Q08639 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Tfdp1Q08639 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Tfdp1Q08639 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Tfdp1Q08639 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tfdp1Q08639 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tfdp1Q08639 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tfdp1Q08639 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tfdp1Q08639 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Tfdp1Q08639 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Tfdp1Q08639 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Tfdp1Q08639 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tfdp1Q08639 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tfdp1Q08639 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tfdp1Q08639 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tfdp1Q08639 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tfdp1Q08639 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tfdp1Q08639 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Tfdp1Q08639 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tfdp1Q08639 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Tfdp1Q08639 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tfdp1Q08639 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tfdp1Q08639 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Tfdp1Q08639 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tfdp1Q08639 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tfdp1Q08639 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Tfdp1Q08639 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tfdp1Q08639 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tfdp1Q08639 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Tfdp1Q08639 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Tfdp1Q08639 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tfdp1Q08639 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tfdp1Q08639 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tfdp1Q08639 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tfdp1Q08639 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Tfdp1Q08639 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Tfdp1Q08639 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tfdp1Q08639 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tfdp1Q08639 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tfdp1Q08639 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Tfdp1Q08639 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tfdp1Q08639 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tfdp1Q08639 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Tfdp1Q08639 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Tfdp1Q08639 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tfdp1Q08639 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tfdp1Q08639 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tfdp1Q08639 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tfdp1Q08639 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tfdp1Q08639 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tfdp1Q08639 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Tfdp1Q08639 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tfdp1Q08639 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tfdp1Q08639 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tfdp1Q08639 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tfdp1Q08639 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Tfdp1Q08639 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tfdp1Q08639 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tfdp1Q08639 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tfdp1Q08639 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms