RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	MMP8	P22894	467 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	NOS2	P35228	1153 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	FLT3	P36888	993 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	SCNN1A	P37088	669 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	MATK	P42679	507 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	PTP4A2	Q12974	167 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	NME3	Q13232	169 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CRY1	Q16526	586 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	LPAL2	Q16609	132 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	NPY6R	Q99463	290 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	SYT11	Q9BT88	431 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	STIM2	Q9P246	746 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CKAP5	Q14008	2032 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	WASH3P	C4AMC7	463 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985		I6L893	689 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985		M0QYT0	321 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	AXIN1	O15169	862 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	APBB3	O95704	486 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	APOE	P02649	317 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	FER	P16591	822 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TACR2	P21452	398 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	HLA-F	P30511	346 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	PBX1	P40424	430 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	UBASH3A	P57075	661 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF445	P59923	1031 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TPM4	P67936	248 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CENPC	Q03188	943 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	EOGT	Q5NDL2	527 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	ANO7	Q6IWH7	933 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	LGI2	Q8N0V4	545 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	NT5C3B	Q969T7	300 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TBCB	Q99426	244 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CFAP54	Q96N23	3096 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	THADA	Q6YHU6	1953 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF292	O60281	2723 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A1W2PQF6	199 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	ADCY5	O95622	1261 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	NTSR1	P30989	418 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CCR1	P32246	355 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	GBP1	P32455	592 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CD70	P32970	193 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	GGCX	P38435	758 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	SULT1E1	P49888	294 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	DGKE	P52429	567 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	RAB6C	Q53S08	254 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	RASSF3	Q86WH2	238 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CHSY1	Q86X52	802 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	DCLK2	Q8N568	766 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	EMC1	Q8N766	993 aa		11.65	□□□□□ -0.54

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