RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TRIOO75962 3097 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ZNF839A8K0R7 811 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 EXTL3O43909 919 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 AFPP02771 609 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TMEM253P0C7T8 217 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 RBP3P10745 1247 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ATP1A3P13637 1013 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 DARSP14868 501 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 HOXD13P35453 343 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 THPOP40225 353 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 GPR3P46089 330 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 UBXN1Q04323 297 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 BFSP2Q13515 415 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 KRT31Q15323 416 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 VWA3BQ502W6 1294 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 VASNQ6EMK4 673 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 NOTUMQ6P988 496 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 SERINC5Q86VE9 423 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 GPD1LQ8N335 351 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 CAGE1Q8TC20 777 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 CALML6Q8TD86 181 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 CCDC51Q96ER9 411 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 FNBP1Q96RU3 617 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 NUP58Q9BVL2 599 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 VPS16Q9H269 839 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 DMAC2Q9NW81 257 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TBX21Q9UL17 535 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 SQORQ9Y6N5 450 aa7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 CFAP54Q96N23 3096 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 A0A0B4J269 797 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 LGALS16A8MUM7 142 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 OGTO15294 1046 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 AKAP10O43572 662 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 GPR32O75388 356 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 RPS6KA5O75582 802 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 PRLP01236 227 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 MCF2P10911 925 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 PFKLP17858 780 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 CCND1P24385 295 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 GTF2H1P32780 548 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 RAB27AP51159 221 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 IRAK1P51617 712 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 VAMP7P51809 220 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 AP3M2P53677 418 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 GSDMDP57764 484 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 PFKPQ01813 784 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ROM1Q03395 351 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 TRIM14Q14142 442 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 SNX27Q96L92 541 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 MED15Q96RN5 788 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 PPP1R16BQ96T49 567 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 NDST4Q9H3R1 872 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.81□□□□□ -1.16
HERC3-210ENST00000512194 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms