RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WWOXQ9NZC7 414 aa18.51■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BIRC5O15392 142 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CYP2F1P24903 491 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NUMBP49757 651 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MAP3K7CLP57077 242 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ATP1A4Q13733 1029 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KAT2BQ92831 832 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TLCD1Q96CP7 247 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UBP1Q9NZI7 540 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RAD54BQ9Y620 910 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ATRNO75882 1429 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TJAP1Q5JTD0 557 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SVOPQ8N4V2 548 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VGLL2Q8N8G2 317 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OSMRQ99650 979 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLC25A23Q9BV35 468 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TSPAN16Q9UKR8 245 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AGLP35573 1532 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DCXO43602 365 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DPYSL3Q14195 570 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TTLL9Q3SXZ7 439 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SNX32Q86XE0 403 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TBC1D19Q8N5T2 526 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ALLCQ8N6M5 410 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RRN3Q9NYV6 651 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMIM22K7EJ46 135 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DNM1LO00429 736 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LIASO43766 372 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 INSRRP14616 1297 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DNAJB2P25686 324 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BST2Q10589 180 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PPP4R4Q6NUP7 873 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLC9A9Q8IVB4 645 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DHRSXQ8N5I4 330 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TSPAN14Q8NG11 270 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AK5Q9Y6K8 562 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.5■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GPR182O15218 404 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ASNA1O43681 348 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TGFB3P10600 412 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HK2P52789 917 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ARMCX4Q5H9R4 360 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FBXO32Q969P5 355 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ACSS3Q9H6R3 686 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RNF112Q9ULX5 631 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C5orf60A6NFR6 353 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MLH1P40692 756 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WASHC5Q12768 1159 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DNERQ8NFT8 737 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NDNQ99608 321 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BBS2Q9BXC9 721 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FBXO21O94952 628 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LDLRP01130 860 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ITGAVP06756 1048 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 THP07101 528 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NDST1P52848 882 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CACHD1Q5VU97 1274 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRIM24O15164 1050 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DGUOKQ16854 277 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FUT11Q495W5 492 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UGT3A1Q6NUS8 523 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM71AQ8IYT1 594 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COMMD8Q9NX08 183 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DMTF1Q9Y222 760 aa18.49■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VWA5AO00534 786 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TKTL1P51854 596 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 INAQ16352 499 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HSD3B7Q9H2F3 369 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 STMN3Q9NZ72 180 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HACD1B0YJ81 288 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 F5H5T6 163 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VPS26AO75436 327 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FBXW4P57775 412 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms