RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF470Q6ECI4 717 aa13.69□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 CAVIN3Q969G5 261 aa13.69□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 PHF21BQ96EK2 531 aa13.69□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.69□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa13.69□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 C2CD2Q9Y426 696 aa13.69□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 FMN2Q9NZ56 1722 aa13.69□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 PCDH8O95206 1070 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 CD52P31358 61 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ITGA9Q13797 1035 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 GALNTL6Q49A17 601 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 CACHD1Q5VU97 1274 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 PHACTR4Q8IZ21 702 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 FAM162AQ96A26 154 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 FAR2Q96K12 515 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 APBA2Q99767 749 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 HSD3B7Q9H2F3 369 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 EFCAB1Q9HAE3 211 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 SOX13Q9UN79 622 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 RIPK2O43353 540 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 PRIM2P49643 509 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 RTP1P59025 263 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ARSHQ5FYA8 562 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 JADE3Q92613 823 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 LPPQ93052 612 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 NEUROG2Q9H2A3 272 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF556Q9HAH1 456 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ABCC13Q9NSE7 274 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 OCM2P0CE71 109 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 SERPINB5P36952 375 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 HPCAP84074 193 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 TMC3Q7Z5M5 1100 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 KATNAL2Q8IYT4 538 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 MAGEB18Q96M61 343 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 VAT1Q99536 393 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 IKZF4Q9H2S9 585 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 SELENONQ9NZV5 590 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 GOLGA8TH3BQL2 631 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 FAM153BP0C7A2 387 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 TPBGLP0DKB5 382 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ITGB6P18564 788 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 BGNP21810 368 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 PLD1Q13393 1074 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 MAMLD1Q13495 774 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ECM1Q16610 540 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 FAM153CQ494X1 144 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 OTOAQ7RTW8 1153 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 CACUL1Q86Y37 369 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 CNDP1Q96KN2 507 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 GANQ9H2C0 597 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 FAM153AQ9UHL3 310 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 RGPD1P0DJD0 1748 aa13.68□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 F8W810 466 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 LYPLA2O95372 231 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 THRAP10827 490 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 STARD3Q14849 445 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 KCNMB4Q86W47 210 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 SYT17Q9BSW7 474 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC134Q9H6E4 229 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 WDR27A2RRH5 827 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 PDZK1P1A8MUH7 402 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 ARIH2O95376 493 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 CCNE2O96020 404 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 HLA-DPA1P20036 260 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 NME5P56597 212 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 MAP3K10Q02779 954 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 TMED1Q13445 227 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 PPM1LQ5SGD2 360 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 BAP1Q92560 729 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 WDR41Q9HAD4 459 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 SEPT3Q9UH03 358 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 HAO1Q9UJM8 370 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 DTNAQ9Y4J8 743 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 A0A096LPK6 155 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 GLTPD2A6NH11 291 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 E9PBE3 544 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 CES2O00748 559 aa13.67□□□□□ -0.22
HDLBP-241ENST00000487169 KLHL41O60662 606 aa13.67□□□□□ -0.22
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