RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483344.1

FNDC3B-210, Transcript of fibronectin type III domain containing 3B, human

TSL 3

Gene FNDC3B, Length 666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FNDC3B-210	ENST00000483344	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	NCAM2	O15394	837 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	RXRA	P19793	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SLC8A1	P32418	973 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	AGTR2	P50052	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	FOXL2	P58012	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	TAS2R50	P59544	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PDCL	Q13371	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CNGA3	Q16281	694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	TBATA	Q96M53	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	COG8	Q96MW5	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PIGS	Q96S52	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	DERA	Q9Y315	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SEPT4	O43236	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PYGL	P06737	847 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CYP21A2	P08686	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CKMT1A	P12532	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PEPD	P12955	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PCP4	P48539	62 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	RCAN1	P53805	252 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	TGFB2	P61812	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CYP3A7	P24462	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	NDUFS1	P28331	727 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	GAB1	Q13480	694 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PRY	O14603	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CYP2D6	P10635	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	IGFBP2	P18065	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CNTF	P26441	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	HOXD12	P35452	270 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	STAT6	P42226	847 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	VPS41	P49754	854 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	COL10A1	Q03692	680 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	UBE3A	Q05086	875 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNDC3B-210	ENST00000483344	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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