RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 ARID5AQ03989 594 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-209ENST00000473257 PNOCQ13519 176 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-209ENST00000473257 NFIL3Q16649 462 aa11.7□□□□□ -0.54
ACTB-209ENST00000473257 PTPRNQ16849 979 aa11.7□□□□□ -0.54
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ACTB-209ENST00000473257 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.7□□□□□ -0.54
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ACTB-209ENST00000473257 PM20D1Q6GTS8 502 aa11.7□□□□□ -0.54
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ACTB-209ENST00000473257 MPPE1Q53F39 396 aa11.68□□□□□ -0.54
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ACTB-209ENST00000473257 RNF139Q8WU17 664 aa11.68□□□□□ -0.54
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ACTB-209ENST00000473257 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
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ACTB-209ENST00000473257 SLC2A11Q9BYW1 496 aa11.68□□□□□ -0.54
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ACTB-209ENST00000473257 WNT9AO14904 365 aa11.67□□□□□ -0.54
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ACTB-209ENST00000473257 ZNF202O95125 648 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-209ENST00000473257 MYL1P05976 194 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-209ENST00000473257 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ACTB-209ENST00000473257 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ACTB-209ENST00000473257 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ACTB-209ENST00000473257 DAOAP59103 153 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-209ENST00000473257 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ACTB-209ENST00000473257 KRT85P78386 507 aa11.67□□□□□ -0.54
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