RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 OPLAHO14841 1288 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 EFCAB14O75071 495 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 DSG3P32926 999 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 KCNJ2P63252 427 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 NEDD8Q15843 81 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 RHOCP08134 193 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC130P13994 396 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANGPT1Q15389 498 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CNGA2Q16280 664 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNF180Q86T96 592 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 WDR48Q8TAF3 677 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 AGAP11Q8TF27 550 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MROH8Q9H579 483 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZMPSTE24O75844 475 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSMB9P28065 219 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CENPAP49450 140 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CDK16Q00536 496 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 GRIK4Q16099 956 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CROTQ9UKG9 612 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SH3BGRLO75368 114 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 FBXO21O94952 628 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 GSTM1P09488 218 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 FASP25445 335 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 RGS2P41220 211 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRELID2Q8N945 189 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 REPS2Q8NFH8 660 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 OPTNQ96CV9 577 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYLDQ9NQC7 956 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 KRT87PA6NCN2 255 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MRASO14807 208 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CRTAMO95727 393 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRG1P02750 347 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ADRB2P07550 413 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ITGALP20701 1170 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 NCALDP61601 193 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MGAT4DA6NG13 374 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 WASHC5Q12768 1159 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 BAP1Q92560 729 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 NWD1Q149M9 1564 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 FGFR3P22607 806 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 TUBP50607 506 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRIM69Q86WT6 500 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 MPP4Q96JB8 637 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 TBCBQ99426 244 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 RMND5AQ9H871 391 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 PARVBQ9HBI1 364 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CLOCKO15516 846 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 APOC2P02655 101 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 LTFP02788 710 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CHKAP35790 457 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCT8P50990 548 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATP1A4Q13733 1029 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 STK32CQ86UX6 486 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNF145Q96MT1 663 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 RGS18Q9NS28 235 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-201ENST00000366959 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms