RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM17Q9Y577 477 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 NCAM2O15394 837 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 GSSP48637 474 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 RARRES1P49788 294 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 CDH17Q12864 832 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 RETSATQ6NUM9 610 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 PALB2Q86YC2 1186 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 SPACA7Q96KW9 195 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 SOX6P35712 828 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 KAZALD1Q96I82 304 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 APBA2Q99767 749 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 NBNO60934 754 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 IFNA14P01570 189 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 USP6NLQ92738 828 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC18P0CG32 403 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 AMPD2Q01433 879 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 GRTP1Q5TC63 336 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 MID1IP1Q9NPA3 183 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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PTPRM-201ENST00000332175 FNDC5Q8NAU1 212 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO39Q8N4B4 442 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.87■■□□□ 1.25
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PTPRM-201ENST00000332175 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 H0YC42 278 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 RAD51BO15315 384 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 SEC22BO75396 215 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 IGSF6O95976 241 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 PGAM1P18669 254 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINB11Q96P15 392 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 KCNK1O00180 336 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 VAPBO95292 243 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 CALCAP01258 141 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 GLI1P08151 1106 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPRM-201ENST00000332175 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 TGFB3P10600 412 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 GRK4P32298 578 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 FAM228AQ86W67 206 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 FAM9CQ8IZT9 166 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPRM-201ENST00000332175 NUDT14O95848 222 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEB16A2A368 324 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPRM-201ENST00000332175 TM9SF1O15321 606 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 CALB2P22676 271 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 ERVK-9P63128 1117 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 IL5RAQ01344 420 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 TBCELQ5QJ74 424 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 OR56A5P0C7T3 313 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 VTA1Q9NP79 307 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 POLG2Q9UHN1 485 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 NCF4Q15080 339 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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PTPRM-201ENST00000332175 BCL2L1Q07817 233 aa22.85■■□□□ 1.25
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PTPRM-201ENST00000332175 PRKAA1Q13131 559 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 FAM83AQ86UY5 434 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB107AQ8IZN7 70 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM2Q99965 735 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 COMMD8Q9NX08 183 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 SYBUQ9NX95 663 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 TISP43B9A030 160 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 SLCO1B7G3V0H7 640 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 IGFBP4P22692 258 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 DET1Q7L5Y6 550 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 COMMD2Q86X83 199 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 DPP10Q8N608 796 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 CRYL1Q9Y2S2 319 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRM-201ENST00000332175 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
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