RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 TLCD1Q96CP7 247 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SNF8Q96H20 258 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB18PQ96TA0 734 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CGRRF1Q99675 332 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 APOL6Q9BWW8 343 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MIOSQ9NXC5 875 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FNIP2Q9P278 1114 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 SNX24Q9Y343 169 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 HES2Q9Y543 173 aa7.35□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 TENM4Q6N022 2769 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.35□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL5CA6NH57 179 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 C4orf47A7E2U8 309 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TISP43B9A030 160 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MAN2B1O00754 1011 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RASGRF2O14827 1237 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 PROSCO94903 275 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 EPN2O95208 641 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRNB1P11230 501 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ATF2P15336 505 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FCARP24071 287 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CNR2P34972 360 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 GUCY1A3Q02108 690 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PTK6Q13882 451 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 USP41Q3LFD5 358 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZACNQ401N2 412 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZPBP2Q6X784 338 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP57Q86XR8 500 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAAF5Q86Y56 855 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC89Q8N998 374 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 EXD1Q8NHP7 514 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT35Q92764 455 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 C18orf8Q96DM3 657 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CABS1Q96KC9 395 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINB12Q96P63 405 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MINDY3Q9H8M7 445 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PARVAQ9NVD7 372 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.34□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNA1EQ15878 2313 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMARCE1-201ENST00000264640 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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SMARCE1-201ENST00000264640 FSBPO95073 299 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 STBD1O95210 358 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RHOP08100 348 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CLTAP09496 248 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RARAP10276 462 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PYGMP11217 842 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GNA15P30679 374 aa7.33□□□□□ -1.24
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