RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 PTPN9P43378 593 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 NOMO3P69849 1222 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 EPC2Q52LR7 807 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PCID2Q5JVF3 399 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 VHLP40337 213 aa6.5□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 CORO7P57737 925 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KCNK10P57789 538 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MAMLD1Q13495 774 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 KRT72Q14CN4 511 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 NUP93Q8N1F7 819 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DUSP16Q9BY84 665 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TCEA3O75764 348 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PGM1P36871 562 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SLC20A2Q08357 652 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MON1AQ86VX9 555 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TRPA1O75762 1119 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CDH18Q13634 790 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 BBS12Q6ZW61 710 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 APOPT1Q96IL0 206 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 CYP2A7P20853 494 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TWF1Q12792 350 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TRIM60Q495X7 471 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 MPP5Q8N3R9 675 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ECT2Q9H8V3 914 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.49□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 LTFP02788 710 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ALLCQ8N6M5 410 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ATL1Q8WXF7 558 aa6.49□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 GPR88Q9GZN0 384 aa6.49□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TGFB1I1O43294 461 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PDGFRBP09619 1106 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ARL2P36404 184 aa6.49□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 FGD4Q96M96 766 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CLPBQ9H078 707 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 VPS51Q9UID3 782 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 SERPINE1P05121 402 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PFKMP08237 780 aa6.49□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 SPATS1Q496A3 300 aa6.49□□□□□ -1.37
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SETX-201ENST00000224140 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 H0Y626 953 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 TRIM16O95361 564 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 HLA-DPA1P20036 260 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 ADRA1DP25100 572 aa6.49□□□□□ -1.37
SETX-201ENST00000224140 PTPN4P29074 926 aa6.49□□□□□ -1.37
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