RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040111.9

Ttc28-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Ttc28, Length 10,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Smpd2O70572 419 aa9□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 RhocQ62159 193 aa9□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Art3Q8R2G4 371 aa9□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Raver2Q7TPD6 673 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 PpatQ8CIH9 517 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ndufs2Q91WD5 463 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Psmd12Q9D8W5 456 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm14781A2A9Q9 366 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Klra1P20937 262 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ppm1aP49443 382 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Col6a2Q02788 1034 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Mageb5Q14AN0 366 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Q3TYS2 187 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zc3hav1Q3UPF5 946 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 P3h1Q3V1T4 739 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Mcf2lQ64096 1149 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Clec1aQ8BWY2 269 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Mss51Q9D5Z5 446 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Mettl1Q9Z120 268 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Lcn6A2AJB9 181 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Vmn2r7E9PYL5 915 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Vmn2r3H3BJ88 915 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Vmn2r6H3BK29 913 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Sema3cQ62181 751 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zfp263Q8CF60 680 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 UvragQ8K245 698 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr356Q8VFP5 315 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Fam136aQ9CR98 138 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 CroccQ8CJ40 2009 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Vmn2r19G5E8G4 854 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Adamts19P59509 1210 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Abl2Q4JIM5 1182 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Grik5Q61626 979 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Fam167aQ6P1G6 215 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Zfyve1Q810J8 777 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ppm1nQ8BGL1 404 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gtf2h3Q8VD76 309 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ddi1Q9DAF3 408 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Mrps15Q9DC71 258 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Prdm12A2AJ77 365 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm29609Q3UU56 907 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr1057Q7TR75 315 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gtf3c2Q8BL74 907 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 RhoaQ9QUI0 193 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 FdxrQ61578 494 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Asnsd1Q8BFS9 627 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rbm22Q8BHS3 420 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Hps1O08983 704 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Msh2P43247 935 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Acvrl1Q61288 502 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Otud6aQ6IE21 290 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Usp6nlQ80XC3 819 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 PstkQ8BP74 359 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 IntS13Q8QZV7 732 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 AagabQ8R2R3 316 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm20911A0A087WSS0 222 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 F830016B08RikG3UWE2 416 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 St14P56677 855 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Aqp1Q02013 269 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Msx2Q03358 267 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Krt76Q3UV17 594 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 TufmQ8BFR5 452 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 EtnpplQ8BWU8 499 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ccser1Q8C0C4 895 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Apol9bQ8C7I4 310 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 CherpQ8CGZ0 936 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rmnd1Q8CI78 450 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Apol9aQ8VDU3 310 aa8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Pwp1Q99LL5 501 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm21149A0A0G2JFY7 255 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm8237E9Q257 205 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Speer4cG3UXD1 256 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm17019K7N6W5 255 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Aars2Q14CH7 980 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Samd11Q1RNF8 542 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Garem2Q6PAJ3 880 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Gm9758Q80ZT2 255 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Pex5lQ8C437 567 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Parp9Q8CAS9 866 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ccdc63Q8CDV6 558 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ap3m2Q8R2R9 418 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Olfr474Q8VFC9 310 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ace3D0G895 737 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Abi3bpQ59IW6 1179 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Adgre1Q61549 931 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Prrg3Q6PAQ9 231 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Trmt1Q3TX08 663 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ndufa5Q9CPP6 116 aa8.98□□□□□ -0.97
Ttc28-201ENSMUST00000040111 Ssxb9A2BI93 185 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.1 ms