Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Hps1O08983 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Hps1O08983 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hps1O08983 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Hps1O08983 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hps1O08983 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hps1O08983 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Hps1O08983 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Hps1O08983 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Hps1O08983 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Hps1O08983 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hps1O08983 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hps1O08983 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hps1O08983 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hps1O08983 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hps1O08983 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hps1O08983 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Hps1O08983 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hps1O08983 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Hps1O08983 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hps1O08983 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hps1O08983 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Hps1O08983 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hps1O08983 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hps1O08983 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Hps1O08983 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hps1O08983 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hps1O08983 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hps1O08983 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hps1O08983 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hps1O08983 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hps1O08983 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hps1O08983 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps1O08983 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hps1O08983 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hps1O08983 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hps1O08983 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps1O08983 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps1O08983 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hps1O08983 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hps1O08983 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hps1O08983 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps1O08983 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hps1O08983 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps1O08983 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hps1O08983 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps1O08983 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps1O08983 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hps1O08983 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hps1O08983 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps1O08983 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps1O08983 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps1O08983 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps1O08983 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hps1O08983 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Hps1O08983 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hps1O08983 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hps1O08983 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps1O08983 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hps1O08983 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hps1O08983 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hps1O08983 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps1O08983 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hps1O08983 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps1O08983 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hps1O08983 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hps1O08983 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hps1O08983 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hps1O08983 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hps1O08983 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps1O08983 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hps1O08983 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps1O08983 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Hps1O08983 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hps1O08983 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps1O08983 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps1O08983 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hps1O08983 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps1O08983 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps1O08983 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps1O08983 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps1O08983 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hps1O08983 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps1O08983 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps1O08983 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps1O08983 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps1O08983 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps1O08983 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps1O08983 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hps1O08983 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps1O08983 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps1O08983 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hps1O08983 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hps1O08983 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hps1O08983 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hps1O08983 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hps1O08983 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hps1O08983 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hps1O08983 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hps1O08983 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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