RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 RALAP11233 206 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 NR1D1P20393 614 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 COL9A1P20849 921 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 BDNFP23560 247 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 GABRR2P28476 465 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PTPN7P35236 360 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 GRIK1P39086 918 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 KCNJ1P48048 391 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 GPR15P49685 360 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 COPS2P61201 443 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 HTR4Q13639 388 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 TEAD2Q15562 447 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF394Q53GI3 561 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 ATL2Q8NHH9 583 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PCED1BQ96HM7 432 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 GCNAQ96QF7 691 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC3Q9BY71 257 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 NOTCH4Q99466 2003 aa22.39■■□□□ 1.18
SGMS1-210ENST00000619438 PRR33A8MZF0 331 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CSH1P0DML2 217 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CSH2P0DML3 217 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ITIH2P19823 946 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R7Q15435 360 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 KCTD16Q68DU8 428 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CROCCP2Q86T23 111 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TMC8Q8IU68 726 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SDCBP2Q9H190 292 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 NME7Q9Y5B8 376 aa22.39■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 O00370 1275 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CILPO75339 1184 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 GAS8O95995 478 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 RARGP13631 454 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CAV1Q03135 178 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CALCOCO2Q13137 446 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 VSTM1Q6UX27 236 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.38■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 MOSPD3O75425 235 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CDC25CP30307 473 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 MAGEA11P43364 429 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 GAREM2Q75VX8 874 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 MCEEQ96PE7 176 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 KXD1Q9BQD3 176 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 MED10Q9BTT4 135 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.37■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 IVDP26440 423 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 NDST1P52848 882 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 INCA1Q0VD86 236 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 ACOT1Q86TX2 421 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 HOOK3Q86VS8 718 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 STKLD1Q8NE28 680 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 GJB6O95452 261 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 CD19P15391 556 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 GABRB2P47870 512 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 GNGT1P63211 74 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 OGDHQ02218 1023 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 GPR158Q5T848 1215 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 DENND2CQ68D51 928 aa22.36■■□□□ 1.17
SGMS1-210ENST00000619438 UNC93AQ86WB7 457 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms