RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	P4HA2	O15460	535 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CHEK2	O96017	543 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DNTT	P04053	509 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2D6	P10635	497 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	IDE	P14735	1019 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	JUP	P14923	745 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDX5	P30044	214 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXD13	P35453	343 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	THBS3	P49746	956 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC16	Q13042	620 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NOG	Q13253	232 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CUL4A	Q13619	759 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SCARB2	Q14108	478 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RABEP1	Q15276	862 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SESTD1	Q86VW0	696 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	C3orf20	Q8ND61	904 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	APPL2	Q8NEU8	664 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP4	Q8WY91	577 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MUL1	Q969V5	352 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SDF4	Q9BRK5	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG8	Q9BVK2	526 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GHITM	Q9H3K2	345 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS45	Q9NRW7	570 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	EHD3	Q9NZN3	535 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DKK3	Q9UBP4	350 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCF2	Q9UG63	623 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SMTNL1	A8MU46	457 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CHL1	O00533	1208 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF213	O14771	459 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP12	O43422	761 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIAP1	O43715	76 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	AHCYL1	O43865	530 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DOK2	O60496	412 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	INMT	O95050	263 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF20A	O95235	890 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TTLL1	O95922	423 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SCGB1D1	O95968	90 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NR2F6	P10588	404 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RARB	P10826	455 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	AKR1B1	P15121	316 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRM3	P20309	590 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	IL11	P20809	199 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTF	P26441	200 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC7A1	P30825	629 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3CG	P48736	1102 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ARFIP2	P53365	341 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CASP6	P55212	293 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE3A	Q05086	875 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRND	Q07001	517 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ERV3-1	Q14264	604 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TWIST1	Q15672	202 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC157	Q569K6	752 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NAA35	Q5VZE5	725 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GGT6	Q6P531	493 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	BBS12	Q6ZW61	710 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	VSIG1	Q86XK7	387 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	UCMA	Q8WVF2	138 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RUBCN	Q92622	972 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RSC1A1	Q92681	617 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBP10	Q96AY3	582 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	REPS1	Q96D71	796 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCD	Q96DY2	449 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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