RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557295.1

LINC00640-204, long intergenic non-protein coding RNA 640, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00640, Length 708 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00640-204ENST00000557295 PTPAQ15257 358 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 EPHA7Q15375 998 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 FAM187BQ17R55 369 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 INF2Q27J81 1249 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PIP4P1Q86T03 277 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CCDC103Q8IW40 242 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ATL2Q8NHH9 583 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TTC8Q8TAM2 541 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 KCNJ15Q99712 375 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 FZD8Q9H461 694 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MCM8Q9UJA3 840 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 COL4A2P08572 1712 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 F5P12259 2224 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 N4BP3O15049 544 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 DCLK1O15075 740 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LYPLA2O95372 231 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 APBB3O95704 486 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 WNT11O96014 354 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PRKCBP05771 671 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 BCL6P41182 706 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 BRCC3P46736 316 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ARPP19P56211 112 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 IRX4P78413 519 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LMAN2Q12907 356 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SEMA3BQ13214 749 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PMS2CLQ68D20 193 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SYT13Q7L8C5 426 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TMC8Q8IU68 726 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ZFYVE19Q96K21 471 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RGL1Q9NZL6 768 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 GULP1Q9UBP9 304 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 NID2Q14112 1375 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 A0A087X0B3 334 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 PATE3B3GLJ2 98 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 SLC37A4O43826 429 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 SLITRK3O94933 977 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 FGF19O95750 216 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 FUCA1P04066 466 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 GRK2P25098 689 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 GRK3P35626 688 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 SCNN1BP51168 640 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 NLRP5P59047 1200 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 SCAPQ12770 1279 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 PLD1Q13393 1074 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF460Q14592 562 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 FBXO43Q4G163 708 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 LZTR1Q8N653 840 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 BEST2Q8NFU1 509 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 FBXW5Q969U6 566 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 CHFRQ96EP1 664 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 DYDC2Q96IM9 177 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00640-204ENST00000557295 TCEANC2Q96MN5 208 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms