RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-210	ENST00000522344	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344		M0QZQ0	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	NPC1	O15118	1278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	USP12	O75317	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	HOXD12	P35452	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	STAT6	P42226	847 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CBFB	Q13951	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TAF5L	O75529	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	THBS4	P35443	961 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	KAT2B	Q92831	832 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PLA2G6	O60733	806 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ITGA5	P08648	1049 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	AKT1	P31749	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	GRM4	Q14833	912 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	GPR78	Q96P69	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344		H3BNX3	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PCDH17	O14917	1159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PLIN1	O60240	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	UGDH	O60701	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	CER1	O95813	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	PEPD	P12955	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	AKR1A1	P14550	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ME1	P48163	572 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF84	P51523	738 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	MTX1	Q13505	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	STARD3	Q14849	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	GGT6	Q6P531	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPEB4-210	ENST00000522344	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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