RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516697.1

RNU6-180P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 180, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-180P, Length 61 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-180P-201ENST00000516697 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SNX14Q9Y5W7 946 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SNX9Q9Y5X1 595 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RNF215Q9Y6U7 377 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 UMODL1Q5DID0 1318 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 A0A0G2JPF8 293 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 A0A0U1RQF3 1178 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CCDC154A6NI56 674 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TCP11X1B4DZS4 312 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MCIDASD6RGH6 385 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 F8W810 466 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KIR2DS3K7RE56 304 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 AGPSO00116 658 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RHODO00212 210 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CBX4O00257 560 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 NEMP1O14524 444 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PHOX2AO14813 284 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TEX33O43247 280 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KLF4O43474 513 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RGS10O43665 173 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ITM2AO43736 263 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 EDIL3O43854 480 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PPP6R2O75170 966 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SERPINI2O75830 405 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ENDOD1O94919 500 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 WDR47O94967 919 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 F2P00734 622 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 IFNA2P01563 188 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ASLP04424 464 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 IGKV3-11P04433 115 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRKCBP05771 671 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TPOP07202 933 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CSF1RP07333 972 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GNAI3P08754 354 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PATE4P0C8F1 98 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HGFP14210 728 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 EN2P19622 333 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MALP21145 153 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RPS6KB1P23443 525 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KLRC2P26717 231 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MARK3P27448 753 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SMARCA1P28370 1054 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SSTR2P30874 369 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MCM5P33992 734 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GALNSP34059 522 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DRD3P35462 400 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TIMP3P35625 211 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SOX2P48431 317 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 JAK3P52333 1124 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC12A2P55011 1212 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC8A3P57103 927 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRTAP10-10P60014 251 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRTAP12-4P60329 112 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 IL2P60568 153 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GNAI1P63096 354 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DSG1Q02413 1049 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CYP4A11Q02928 519 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RUNX1T1Q06455 604 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PMPCAQ10713 525 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MYO1EQ12965 1108 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SNTA1Q13424 505 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KCNJ12Q14500 433 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRT72Q14CN4 511 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 IQCB1Q15051 598 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PGM5Q15124 567 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HLFQ16534 295 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ATP2B3Q16720 1220 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 C3orf36Q3SXR2 165 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LONRF3Q496Y0 759 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF876PQ49A33 203 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZFP69Q49AA0 526 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CCDC178Q5BJE1 867 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 XKR9Q5GH70 373 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ENTPD8Q5MY95 495 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DACT2Q5SW24 774 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms