RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 OCM2P0CE71 109 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 MLH1P40692 756 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PTF1AQ7RTS3 328 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 FAM153AQ9UHL3 310 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SNHG28P0DPA3 235 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ACADMP11310 421 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 NPR3P17342 541 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CASP5P51878 434 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PRKCQQ04759 706 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SEPT3Q9UH03 358 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 RAB21Q9UL25 225 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 RARAP10276 462 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CRABP2P29373 138 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD23Q86SG2 305 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 HORMAD1Q86X24 394 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 FAM71AQ8IYT1 594 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 HES6Q96HZ4 224 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TKTL2Q9H0I9 626 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 GIT1Q9Y2X7 761 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 MYO1GB0I1T2 1018 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 FKTNO75072 461 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 DMC1Q14565 340 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CCDC153Q494R4 210 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PRR23AA6NEV1 266 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 RASSF10A6NK89 507 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 USP17L7P0C7H9 530 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 BBS7Q8IWZ6 715 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TMEM199Q8N511 208 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PLEKHA8Q96JA3 519 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 MARCH2Q9P0N8 246 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 KANSL1LA0AUZ9 987 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 RNF103O00237 685 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 RIPK2O43353 540 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ADRB2P07550 413 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CEP70Q8NHQ1 597 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PPTC7Q8NI37 304 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP17.47■□□□□ 0.395e-6■□□□□ 8.4
NISCH-213ENST00000489895 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 HEY2Q9UBP5 337 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 MYOM1P52179 1685 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ELK3P41970 407 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 PRIM2P49643 509 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 FAM110CQ1W6H9 321 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 WSCD1Q658N2 575 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CPNE1Q99829 537 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 UBP1Q9NZI7 540 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 BTNL10A8MVZ5 291 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 KDELR1P24390 212 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 GRM5P41594 1212 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 DLG4P78352 724 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TGM3Q08188 693 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 POU6F1Q14863 301 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TRIP10Q15642 601 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 NOMO2Q5JPE7 1267 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SCARA3Q6AZY7 606 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 KCNT2Q6UVM3 1135 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 C12orf56Q8IXR9 622 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 LRRC52Q8N7C0 313 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 IL31RAQ8NI17 732 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ADNPQ9H2P0 1102 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 DERAQ9Y315 318 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TISP43B9A030 160 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SMIM22K7EJ46 135 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CYP1A2P05177 515 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 HSPA13P48723 471 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CDK16Q00536 496 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 CSHL1Q14406 222 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 WDR41Q9HAD4 459 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 BATF3Q9NR55 127 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 NFICP08651 508 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 MSH3P20585 1137 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
NISCH-213ENST00000489895 KCNMB4Q86W47 210 aa17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms